277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1625 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
353 aa  712    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  54.83 
 
 
359 aa  382  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  54.83 
 
 
359 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  54.27 
 
 
365 aa  375  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  48.91 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  46.7 
 
 
366 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  49.71 
 
 
366 aa  324  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  48.61 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  38.79 
 
 
353 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  40.98 
 
 
335 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  37.5 
 
 
351 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  38.18 
 
 
340 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  34.15 
 
 
357 aa  190  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  34.72 
 
 
355 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  34.71 
 
 
355 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  34.71 
 
 
355 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  34.71 
 
 
355 aa  186  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  34.71 
 
 
355 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  34.71 
 
 
355 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  35.67 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  34.42 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  34.93 
 
 
358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  34.82 
 
 
340 aa  182  7e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  38.4 
 
 
403 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  39.4 
 
 
407 aa  176  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  35.67 
 
 
363 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  33.53 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  36.89 
 
 
404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  33.42 
 
 
413 aa  172  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
358 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  35.87 
 
 
713 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  35.31 
 
 
356 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  34.05 
 
 
342 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  33.84 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  31.28 
 
 
355 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  34.25 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  32.97 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  33.94 
 
 
360 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  32.15 
 
 
378 aa  159  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  30.09 
 
 
377 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
356 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  29.97 
 
 
370 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  30.21 
 
 
377 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  31.59 
 
 
330 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  31.71 
 
 
346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  31.69 
 
 
346 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  29.64 
 
 
358 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  33.1 
 
 
327 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  31.29 
 
 
338 aa  142  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  34.88 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  29.23 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  30.7 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  30.46 
 
 
354 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  29.14 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  33.33 
 
 
354 aa  139  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  34.51 
 
 
329 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  32.04 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  34.15 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  29.43 
 
 
356 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  30.95 
 
 
389 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  28.61 
 
 
357 aa  137  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  25.87 
 
 
366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  29.75 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  30.91 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  29.97 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  37.19 
 
 
357 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  32.48 
 
 
334 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  32.18 
 
 
341 aa  133  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  33.1 
 
 
368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  28.9 
 
 
330 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  30.65 
 
 
365 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  32.53 
 
 
380 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  31.13 
 
 
322 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  29.13 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  28.23 
 
 
334 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  31.31 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0807  basic membrane lipoprotein  30.65 
 
 
359 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  29.41 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  28.61 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  30.65 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.34 
 
 
331 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  28.34 
 
 
331 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  33.69 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  30.28 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  29.91 
 
 
358 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  30.4 
 
 
330 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  29.97 
 
 
365 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3949  basic membrane lipoprotein  37.31 
 
 
363 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.017082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1020  basic membrane lipoprotein  27.14 
 
 
368 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  28.14 
 
 
361 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  28.48 
 
 
331 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  28.66 
 
 
349 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  31.51 
 
 
330 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  29.1 
 
 
334 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04890  uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein  32.72 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651216  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  27.53 
 
 
329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  30.49 
 
 
349 aa  119  7e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  28.96 
 
 
339 aa  119  7e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0751  basic membrane lipoprotein  36.68 
 
 
364 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191931  hitchhiker  0.00640834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  29.97 
 
 
368 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>