150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0204 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0204  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 452 aa  907    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0161  radical SAM domain-containing protein  45.61 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0336  radical SAM domain-containing protein  42.76 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0354  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 471 aa  325  9e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  29.74 
 
 		 545 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  30.89 
 
 		 510 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 589 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 589 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 589 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3787  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 525 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 		 551 aa  170  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  29.38 
 
 		 557 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 553 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 557 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 599 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 557 aa  162  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 599 aa  161  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  28.61 
 
 		 559 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 828 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 826 aa  156  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 544 aa  156  9e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 563 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 613 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 593 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 		 613 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 657 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1454  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  24.88 
 
 		 573 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  29 
 
 		 638 aa  147  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 591 aa  147  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 624 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0457  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.211287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 849 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  27.77 
 
 		 532 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.42 
 
 		 894 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 626 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.28 
 
 		 887 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0878  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000778999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 812 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  26.38 
 
 		 544 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 537 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 600 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  24.89 
 
 		 836 aa  136  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 		 874 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 879 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  26.02 
 
 		 842 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  28.13 
 
 		 860 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.7 
 
 		 546 aa  133  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1436  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37868  decreased coverage  0.00181566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 842 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  26.97 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 828 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1195  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  26.86 
 
 		 882 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 828 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0304  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 543 aa  129  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  26.98 
 
 		 898 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 610 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.29 
 
 		 528 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  27.09 
 
 		 910 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 627 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 856 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 611 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 857 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.86 
 
 		 872 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0446  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 439 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.627124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 817 aa  126  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 538 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1544  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  23.97 
 
 		 626 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 		 619 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 852 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 922 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0461  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 597 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 600 aa  123  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0375  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 		 438 aa  123  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0386229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 677 aa  123  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 621 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 663 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 653 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 640 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  26.2 
 
 		 842 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 645 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 617 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 645 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 655 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 633 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 897 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 654 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 663 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18361  Fe-S oxidoreductase  27.03 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 614 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 864 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>