46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0614 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  501  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  88.65 
 
 		 908 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  62.28 
 
 		 917 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  60.18 
 
 		 1042 aa  305  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  58.95 
 
 		 960 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  58.08 
 
 		 955 aa  297  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  58.08 
 
 		 956 aa  295  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  58.08 
 
 		 960 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  58.08 
 
 		 969 aa  295  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  58.08 
 
 		 962 aa  295  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  58.08 
 
 		 963 aa  295  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  58.08 
 
 		 955 aa  294  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  60.89 
 
 		 913 aa  294  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  58.52 
 
 		 949 aa  293  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  56.77 
 
 		 963 aa  292  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  57.64 
 
 		 962 aa  291  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  57.64 
 
 		 962 aa  291  9e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  58.08 
 
 		 978 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  57.64 
 
 		 949 aa  290  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  60 
 
 		 913 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  57.96 
 
 		 889 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  56.39 
 
 		 1002 aa  284  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  56.89 
 
 		 948 aa  279  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  53.51 
 
 		 938 aa  278  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  56.5 
 
 		 941 aa  275  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  54.19 
 
 		 973 aa  272  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  53.95 
 
 		 983 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  53.51 
 
 		 980 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  56.33 
 
 		 954 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  56.33 
 
 		 952 aa  265  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  56.09 
 
 		 954 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  50.44 
 
 		 964 aa  249  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  30.34 
 
 		 924 aa  114  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  32.37 
 
 		 916 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  32.37 
 
 		 916 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  25.33 
 
 		 874 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  23.14 
 
 		 690 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  25.53 
 
 		 818 aa  50.8  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  25.82 
 
 		 847 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.54 
 
 		 629 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  25.54 
 
 		 864 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  27.4 
 
 		 845 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.67 
 
 		 630 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.42 
 
 		 629 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.11 
 
 		 861 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.86 
 
 		 595 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>