263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2578 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  60.08 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2209  protein of unknown function DUF81  64.17 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000506184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  54.04 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  59.81 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  48.98 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  49.81 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  43.09 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  43.85 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  42.35 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  42.35 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  43.53 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  51.78 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  42.8 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  47.95 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  47.01 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  48.81 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  42.35 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  41.96 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  38.76 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  43.75 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  48.61 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  45.68 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  45.78 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  48.12 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  37.8 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  43.02 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  43.02 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  44.26 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  39.34 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  39.68 
 
 		 253 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  39.29 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  38.89 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  39.68 
 
 		 252 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  41.53 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  31.75 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  38.14 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  41.08 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  34.68 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  34.68 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  34.68 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  34.27 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  34.27 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  34.27 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  34.27 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  43.03 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  36.33 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  36.33 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  37.96 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0553  protein of unknown function DUF81  48.94 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  33.87 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  37.96 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  46.55 
 
 		 267 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  35.57 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  36.95 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0959  hypothetical protein  42.72 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  34.15 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  32.94 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  33.74 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06970  predicted permease  45.6 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  34.66 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  39.18 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  34.73 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  36.76 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  36.76 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  36.76 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  33.08 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04790  predicted permease  41.13 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.542879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  32.81 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  32.93 
 
 		 256 aa  141  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  36.75 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  32.68 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  35.29 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  37.76 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  37.2 
 
 		 265 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  42.44 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  41.7 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  37.14 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  32.41 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  35.06 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  33.2 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  36.73 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  32.81 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  38.08 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  32.02 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  35.52 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  34.4 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  33.46 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  34.4 
 
 		 251 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  30.62 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  38.64 
 
 		 261 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  35.43 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  33.33 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  36.33 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  37.8 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>