More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1747 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1747  putative cytochrome P450  100 
 
 
454 aa  907    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0264528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4583  putative cytochrome P450  41.29 
 
 
471 aa  272  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2975  putative cytochrome P450  37.41 
 
 
452 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4334  putative cytochrome P450  37.5 
 
 
484 aa  247  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2597  Cytochrome P450  39.12 
 
 
500 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2803  putative cytochrome P450-family protein  35.41 
 
 
414 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348302  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2751  putative cytochrome P450-family protein  35.01 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.581871  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4556  putative cytochrome P450  36.72 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1433  Cytochrome P450-like protein  34.88 
 
 
424 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.667112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4420  putative cytochrome P450  35.15 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  35.84 
 
 
421 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4184  cytochrome P450 monooxygenase  33.93 
 
 
406 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1685  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5490  putative cytochrome P450  33.25 
 
 
437 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0347822  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5491  putative cytochrome P450  35.59 
 
 
488 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767325  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4812  cytochrome P450-family protein  32.73 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33530  cytochrome P450  32.37 
 
 
410 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101916  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3959  Cytochrome P450-like protein  32.8 
 
 
465 aa  166  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  30.65 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  29.03 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  31.61 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  28.5 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  28.43 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  28.13 
 
 
367 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  31.12 
 
 
406 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  29.34 
 
 
412 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  26.42 
 
 
409 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  25.66 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  28.35 
 
 
400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  28.78 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  30.53 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  27.68 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  27.3 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  27 
 
 
396 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  28.87 
 
 
411 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  31.51 
 
 
436 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  28.85 
 
 
426 aa  113  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  27.7 
 
 
400 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  27.99 
 
 
408 aa  113  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  29.87 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  29.87 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  29.87 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  28.72 
 
 
406 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  25 
 
 
411 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3776  cytochrome P450  27.7 
 
 
413 aa  110  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  25.06 
 
 
416 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  28.16 
 
 
399 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  26.7 
 
 
424 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  27.12 
 
 
395 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  27.51 
 
 
407 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  27.51 
 
 
407 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  27.61 
 
 
418 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  28.88 
 
 
407 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  26.35 
 
 
409 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  24.22 
 
 
411 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  24.8 
 
 
405 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  24.94 
 
 
405 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  23.72 
 
 
411 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  27.81 
 
 
400 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  29.48 
 
 
375 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  26.03 
 
 
421 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  27.51 
 
 
412 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  23.44 
 
 
411 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  29.79 
 
 
399 aa  103  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  27.05 
 
 
395 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  25.67 
 
 
400 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  25.06 
 
 
405 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  28.24 
 
 
402 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  25.81 
 
 
373 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  22.91 
 
 
411 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  27.59 
 
 
398 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  28.12 
 
 
405 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  21.99 
 
 
420 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  29.74 
 
 
402 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  28.11 
 
 
414 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  28.57 
 
 
417 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  29.3 
 
 
399 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  26.34 
 
 
395 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  27.35 
 
 
405 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  27.93 
 
 
409 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  23.44 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  28.12 
 
 
410 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  23.44 
 
 
411 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  23.44 
 
 
411 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  26.65 
 
 
408 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  23.12 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  22.98 
 
 
411 aa  97.8  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  22.98 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  28.72 
 
 
410 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  27.18 
 
 
420 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  26.77 
 
 
427 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  26.77 
 
 
427 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  28.36 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  27.73 
 
 
464 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  26.99 
 
 
398 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  25.19 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  25.39 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  26.48 
 
 
401 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  26.77 
 
 
427 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  26.26 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  26.85 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>