More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0739 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0739  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
447 aa  895    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4104  Coproporphyrinogen dehydrogenase  69.04 
 
 
448 aa  588  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.524988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3236  Coproporphyrinogen dehydrogenase  61.78 
 
 
486 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363144  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1173  coproporphyrinogen III oxidase  58.15 
 
 
445 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.75222  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1841  coproporphyrinogen III oxidase  51.84 
 
 
439 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1642  Coproporphyrinogen dehydrogenase  35.17 
 
 
443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4243  coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 
413 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4222  coproporphyrinogen III oxidase  36.82 
 
 
413 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4879  Coproporphyrinogen dehydrogenase  34.39 
 
 
460 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.49 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.25 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.43 
 
 
380 aa  136  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  27.25 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  26.99 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.34 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  26.99 
 
 
379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  26.99 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  26.74 
 
 
379 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.89 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  26.74 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  23.67 
 
 
380 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  27.44 
 
 
379 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  29.8 
 
 
396 aa  127  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  26.22 
 
 
378 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2366  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.42 
 
 
410 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  26.22 
 
 
378 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.88 
 
 
376 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  27.25 
 
 
378 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  24.23 
 
 
453 aa  123  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.05 
 
 
375 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.68 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  26.27 
 
 
465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.87 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.15 
 
 
385 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2375  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.83 
 
 
374 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.950801  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  22.86 
 
 
451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.34 
 
 
448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.83 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  30.07 
 
 
483 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.14 
 
 
385 aa  120  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  30.07 
 
 
481 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  30.07 
 
 
483 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  21.91 
 
 
377 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  30.07 
 
 
481 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  30.89 
 
 
484 aa  119  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  30.07 
 
 
483 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  30.07 
 
 
483 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  30.07 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.11 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  25.77 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  28.49 
 
 
465 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  24.63 
 
 
376 aa  118  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  25.52 
 
 
379 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  30.46 
 
 
481 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  27.75 
 
 
463 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  26.02 
 
 
458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  21.91 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.3 
 
 
380 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.87 
 
 
377 aa  116  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.89 
 
 
395 aa  116  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  28.46 
 
 
469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1957  coproporphyrinogen III oxidase  27.47 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  26.07 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  24.88 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  31.88 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  28 
 
 
487 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  27.04 
 
 
379 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  24.75 
 
 
378 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4269  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.13 
 
 
401 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281837  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3505  coproporphyrinogen III oxidase  24.88 
 
 
414 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.85 
 
 
365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  23.59 
 
 
379 aa  113  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  25.26 
 
 
382 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.35 
 
 
388 aa  113  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.85 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  24.44 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.12 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  30.39 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  24.25 
 
 
451 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.08 
 
 
380 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1668  coproporphyrinogen III oxidase  35.48 
 
 
437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1104  coproporphyrinogen III oxidase  27.04 
 
 
455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3805  coproporphyrinogen III oxidase  26.85 
 
 
445 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0536703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2113  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.1 
 
 
369 aa  110  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.512598  normal  0.05877 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  22.96 
 
 
455 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3797  coproporphyrinogen III oxidase  28.9 
 
 
437 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0786791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.85 
 
 
457 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 
443 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3885  coproporphyrinogen III oxidase  28.9 
 
 
437 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2002  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.26 
 
 
448 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.55227  normal  0.313368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3571  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.38 
 
 
460 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2187  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.15 
 
 
390 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  24.5 
 
 
451 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.51 
 
 
471 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  24.76 
 
 
396 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  28.35 
 
 
460 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1553  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.99 
 
 
423 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.17 
 
 
371 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  27.85 
 
 
422 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  28.35 
 
 
460 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>