36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0445 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  45.64 
 
 		 211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  35.21 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  36.84 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  35.12 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  30.97 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  35.56 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  37.8 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  35.06 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  29.3 
 
 		 261 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  28.85 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  28.67 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  30.5 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  35.16 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  27.63 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  27.7 
 
 		 310 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  31.1 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  34.44 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  30.19 
 
 		 231 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  28.1 
 
 		 258 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  26.06 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  29.03 
 
 		 254 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  28 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  28.38 
 
 		 295 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.35 
 
 		 257 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  30.53 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  30.11 
 
 		 327 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09620  RDD domain containing protein  26.88 
 
 		 302 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  32.73 
 
 		 241 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  30.38 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  33 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  29.75 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  29.75 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  28.21 
 
 		 150 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  29.75 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>