More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0276 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.71 
 
 		 254 aa  394  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.23 
 
 		 254 aa  339  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  67.59 
 
 		 253 aa  332  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  67.32 
 
 		 254 aa  329  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  66.8 
 
 		 253 aa  326  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  64.96 
 
 		 254 aa  316  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  64.57 
 
 		 254 aa  309  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  62.85 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.11 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  64.43 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  65.27 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.13 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  65.27 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  65.27 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  63.1 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.22 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  57.71 
 
 		 257 aa  285  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  61.26 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  62.85 
 
 		 254 aa  272  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  61.75 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  62.4 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.6 
 
 		 285 aa  261  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.4 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.07 
 
 		 249 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  51.41 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  46.27 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.31 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  46.27 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  45.34 
 
 		 264 aa  184  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 		 273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.15 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 		 263 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.98 
 
 		 797 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 		 269 aa  168  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  42.69 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  40.65 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  41.94 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  41.92 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.07 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5251  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.03 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  42.11 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  42.11 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  36.69 
 
 		 663 aa  158  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  40.77 
 
 		 261 aa  158  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  40.77 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  40.77 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  41.7 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  40.77 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  40.77 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  40.38 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  40.77 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  39.43 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  41.7 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  37.65 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  40.77 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.99 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>