More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0181 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  100 
 
 		 327 aa  657    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5418  Transketolase central region  82.15 
 
 		 326 aa  554  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  75.46 
 
 		 324 aa  484  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  70.82 
 
 		 329 aa  484  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  73.93 
 
 		 327 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  70.82 
 
 		 329 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  72.64 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0329  Transketolase central region  74.06 
 
 		 335 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  69.3 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3966  Transketolase central region  70.43 
 
 		 357 aa  454  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0092  Transketolase central region  69.85 
 
 		 331 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  67.98 
 
 		 353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6982  Transketolase central region  68.2 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  68.71 
 
 		 326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  64.74 
 
 		 329 aa  441  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  69.04 
 
 		 327 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0032  transketolase, central region  69.97 
 
 		 327 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  68.17 
 
 		 357 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6069  Transketolase central region  66.67 
 
 		 328 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  65.23 
 
 		 336 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  65.06 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4027  transketolase, central region  65.34 
 
 		 326 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3817  Transketolase central region  64.65 
 
 		 326 aa  425  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  64.63 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0987322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  61.71 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  66.46 
 
 		 706 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  64.22 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  66.57 
 
 		 345 aa  421  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38870  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  64.63 
 
 		 345 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  63.58 
 
 		 335 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2098  Transketolase central region  64.2 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3399  Transketolase central region  68.83 
 
 		 308 aa  408  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06810  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  63.69 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.643583  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  61.8 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  59.06 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  58.77 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  58.77 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  60.44 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  58.77 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  57.98 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  58.18 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  56.56 
 
 		 344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6170  Transketolase central region  59.06 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0762568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  56.39 
 
 		 330 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  54.13 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  54.74 
 
 		 370 aa  343  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2487  transketolase  56.56 
 
 		 329 aa  342  4e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.511484  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  54.24 
 
 		 373 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  56.66 
 
 		 334 aa  331  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  54.21 
 
 		 342 aa  329  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  54.63 
 
 		 324 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  48.94 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  52.5 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  56.31 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  54.94 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  54.94 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  51.09 
 
 		 322 aa  324  2e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  53.09 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  53.29 
 
 		 327 aa  315  5e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  49.55 
 
 		 346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  52.01 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  50.15 
 
 		 325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  51.84 
 
 		 326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  51.88 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  50.61 
 
 		 326 aa  305  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  49.85 
 
 		 328 aa  305  8.000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  52.32 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  49.84 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  49.54 
 
 		 335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  48.92 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  47.98 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  49.7 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.09 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.09 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  50.62 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  51.25 
 
 		 355 aa  299  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.7 
 
 		 351 aa  299  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.06 
 
 		 337 aa  298  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  49.38 
 
 		 330 aa  298  7e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  47.69 
 
 		 325 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  47.55 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  47.55 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  48.31 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  47.72 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  52.05 
 
 		 326 aa  295  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  47.66 
 
 		 332 aa  295  8e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  49.52 
 
 		 332 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  50.47 
 
 		 702 aa  295  9e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4402  2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit  47.43 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  48.28 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  48.46 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  48.89 
 
 		 332 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.59 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1321  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.04 
 
 		 347 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3066  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  47.04 
 
 		 347 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2012  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.04 
 
 		 347 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2301  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.04 
 
 		 347 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1035  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.04 
 
 		 347 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1452  transketolase, central region  47.83 
 
 		 352 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3192  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  47.04 
 
 		 347 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.55833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>