117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4708 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  100 
 
 		 159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  55.73 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  49.28 
 
 		 140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  47.83 
 
 		 140 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  44.03 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  42.54 
 
 		 127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  41.04 
 
 		 127 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  34.62 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  29.32 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  32.73 
 
 		 115 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  32.73 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  31.3 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.82 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.82 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.82 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.82 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.82 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.82 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.82 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16581  ribonuclease P protein component  29.13 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  31.82 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  30.83 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12711  ribonuclease P protein component  26.92 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373516 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  38.67 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  31.3 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  31.45 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  43.06 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  28.33 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  29.77 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  36.44 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  29.41 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  29.85 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1615  ribonuclease P  36.72 
 
 		 122 aa  51.6  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.166425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  30.33 
 
 		 118 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  30.33 
 
 		 118 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  30.33 
 
 		 118 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  34.29 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  27.64 
 
 		 114 aa  50.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  30.08 
 
 		 127 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  30.89 
 
 		 123 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  34.82 
 
 		 130 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0803  ribonuclease P protein component  27.56 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  38.24 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  29.17 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  34.15 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  28.89 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  39.73 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  31.15 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  34.58 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  33.33 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1285  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.240066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  31.51 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  30.08 
 
 		 124 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  39.73 
 
 		 121 aa  48.1  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  28 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  26.67 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  34.95 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 240 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  35.65 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  34.95 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  36.11 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  32.46 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  35.62 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  34.78 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  40.79 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  39.47 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  27.97 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  28.1 
 
 		 115 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  29.27 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  29.66 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  29.51 
 
 		 109 aa  44.3  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0579  ribonuclease P protein component of ribozyme  26.83 
 
 		 128 aa  44.3  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  28.33 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  24.39 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  28.69 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  39.71 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  36.78 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  28.38 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  34.38 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  30.14 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  29.57 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  31.94 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  29.36 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  39.71 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  33.82 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  30.49 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  29.33 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  31.31 
 
 		 107 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  30.97 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>