More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4031 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
341 aa  696    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  60.41 
 
 
332 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  59.76 
 
 
344 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  59.17 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  55.04 
 
 
346 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  55.16 
 
 
332 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  53.2 
 
 
329 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2567  thiamine monophosphate kinase  47.06 
 
 
327 aa  264  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0027  thiamine-monophosphate kinase  38.35 
 
 
331 aa  199  7e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0031  thiamine-monophosphate kinase  37.24 
 
 
328 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0024  thiamine-phosphate kinase  35.67 
 
 
328 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1351  thiamine-phosphate kinase  34.96 
 
 
327 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  35.23 
 
 
328 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00281  putative thiamine-monophosphate kinase  37.93 
 
 
327 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  34.67 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.554976  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  34.69 
 
 
329 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  32.22 
 
 
328 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.259718  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  35.17 
 
 
335 aa  159  7e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00241  putative thiamine-monophosphate kinase  33.04 
 
 
336 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.208498  normal  0.107796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  29.62 
 
 
334 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  31.34 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  31.46 
 
 
337 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  34.47 
 
 
319 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.47 
 
 
318 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  34.78 
 
 
325 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  35.09 
 
 
325 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  35.09 
 
 
325 aa  146  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  36.94 
 
 
327 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  35.09 
 
 
325 aa  146  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  35.09 
 
 
325 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  33.73 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  35.09 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  34.78 
 
 
325 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  34.7 
 
 
340 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  34.78 
 
 
325 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  34.78 
 
 
325 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  34.16 
 
 
329 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  37.23 
 
 
325 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  34.27 
 
 
329 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  35.45 
 
 
318 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.45 
 
 
318 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.45 
 
 
318 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  31.56 
 
 
323 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.85 
 
 
329 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  32.2 
 
 
333 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  30.97 
 
 
355 aa  142  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  34.98 
 
 
319 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  32.53 
 
 
354 aa  142  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.52 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  32.84 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  29.51 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  32.91 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  32.18 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  38.15 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  36.13 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.26 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 
322 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  33.44 
 
 
321 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  33.43 
 
 
363 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  30.7 
 
 
340 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  31.25 
 
 
354 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  33.02 
 
 
322 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  34.08 
 
 
318 aa  139  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  36.19 
 
 
324 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  34.94 
 
 
323 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  34.94 
 
 
323 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  34.94 
 
 
323 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  35.82 
 
 
324 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  37.04 
 
 
326 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  31.33 
 
 
325 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  32.7 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  33.85 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  32.81 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  34.94 
 
 
323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  34.57 
 
 
323 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  33.85 
 
 
322 aa  135  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  31.07 
 
 
337 aa  135  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  32.98 
 
 
358 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  32.5 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  30.68 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  33.85 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  33.85 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  32.51 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  33.04 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  33.85 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  29.36 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  31.13 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  31.55 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  28.49 
 
 
336 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  31.23 
 
 
341 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  30.53 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  30.26 
 
 
320 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  31.35 
 
 
346 aa  132  9e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  32.1 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  32.47 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  30.49 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  31.1 
 
 
318 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  31.37 
 
 
346 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  35.23 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  34.47 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>