57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3332 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
477 aa  948    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0006  von Willebrand factor, type A  45.62 
 
 
592 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  34.44 
 
 
462 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  30.23 
 
 
425 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.65 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  30.72 
 
 
441 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
903 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.03 
 
 
588 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 
328 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  31.32 
 
 
472 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  27.5 
 
 
419 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  28.03 
 
 
744 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.77 
 
 
472 aa  54.3  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
418 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  33.03 
 
 
1313 aa  53.5  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  30.37 
 
 
643 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  31.16 
 
 
412 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  26.47 
 
 
222 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  32.87 
 
 
575 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.87 
 
 
575 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.91 
 
 
479 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  29.37 
 
 
474 aa  51.6  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  33.55 
 
 
593 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  33.55 
 
 
598 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  28.66 
 
 
383 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 
546 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 
325 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  31.68 
 
 
795 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 
520 aa  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.25 
 
 
3027 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 
421 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 
467 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  29.61 
 
 
393 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 
1204 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  26.17 
 
 
308 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  29.63 
 
 
327 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  31.79 
 
 
582 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  27.49 
 
 
415 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
319 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  29.79 
 
 
951 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  25 
 
 
605 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 
219 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  28.95 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 
592 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  25.25 
 
 
233 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  24.1 
 
 
1188 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  28.96 
 
 
566 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2394  von Willebrand factor, type A  27.17 
 
 
972 aa  44.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.400523  hitchhiker  0.00000432302 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 
418 aa  44.3  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  27.08 
 
 
819 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 
505 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 
918 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  30.66 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  29.71 
 
 
412 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>