More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0907 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  74.24 
 
 
548 aa  819    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  81.9 
 
 
540 aa  920    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  81.94 
 
 
537 aa  930    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  75.34 
 
 
528 aa  815    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  82.84 
 
 
540 aa  944    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  77.04 
 
 
528 aa  847    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  76.23 
 
 
528 aa  838    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  76.04 
 
 
528 aa  840    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  56.81 
 
 
516 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  69.85 
 
 
528 aa  778    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  80.75 
 
 
575 aa  923    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  83.62 
 
 
542 aa  927    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  83.62 
 
 
542 aa  927    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  57.42 
 
 
510 aa  641    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  100 
 
 
575 aa  1191    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  71.07 
 
 
528 aa  780    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  59.38 
 
 
510 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  75.73 
 
 
528 aa  819    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  81.02 
 
 
542 aa  923    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  70.1 
 
 
528 aa  770    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  57.17 
 
 
517 aa  653    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  69.66 
 
 
528 aa  773    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  55.6 
 
 
516 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.21 
 
 
516 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  57.56 
 
 
516 aa  628  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  56.35 
 
 
518 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  57.59 
 
 
511 aa  627  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  56.78 
 
 
513 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  57.39 
 
 
512 aa  625  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  56.81 
 
 
512 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  56.81 
 
 
512 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  56.81 
 
 
512 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  56.81 
 
 
515 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  56.81 
 
 
515 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  56.81 
 
 
515 aa  623  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  56.81 
 
 
515 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  56.81 
 
 
512 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  56.76 
 
 
512 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  55.32 
 
 
513 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  56.61 
 
 
512 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  56.61 
 
 
512 aa  619  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  56.26 
 
 
510 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  56.35 
 
 
511 aa  618  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  54.74 
 
 
509 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.93 
 
 
509 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  55.19 
 
 
511 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  56.18 
 
 
533 aa  609  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.72 
 
 
512 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  55.79 
 
 
560 aa  606  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.51 
 
 
511 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  55.05 
 
 
560 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.99 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  54.73 
 
 
522 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  55.73 
 
 
506 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  55.53 
 
 
517 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  53.65 
 
 
514 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  55.26 
 
 
534 aa  599  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.5 
 
 
510 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  55.13 
 
 
513 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  55.13 
 
 
513 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  53.4 
 
 
509 aa  600  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  55.13 
 
 
513 aa  597  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  55.07 
 
 
556 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  54.65 
 
 
509 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  54.2 
 
 
517 aa  595  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  54.63 
 
 
510 aa  592  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  53.93 
 
 
533 aa  591  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  54.04 
 
 
514 aa  588  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  54.04 
 
 
514 aa  588  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  53.76 
 
 
510 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  54.26 
 
 
512 aa  587  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  53.31 
 
 
511 aa  588  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  53.35 
 
 
531 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  52.91 
 
 
513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  52.96 
 
 
528 aa  581  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  54.93 
 
 
535 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  52.69 
 
 
518 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  52.12 
 
 
518 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  52.5 
 
 
518 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  53.98 
 
 
513 aa  579  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  52.33 
 
 
512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  52.71 
 
 
507 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  52.5 
 
 
518 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  53.95 
 
 
565 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  53.1 
 
 
512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  53.49 
 
 
515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  53.58 
 
 
520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  53.95 
 
 
525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  52.61 
 
 
520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  54.01 
 
 
523 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  53.29 
 
 
514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  53.76 
 
 
556 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  52.61 
 
 
520 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  54.07 
 
 
515 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  51.35 
 
 
512 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  53.26 
 
 
525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  53 
 
 
523 aa  570  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  52.8 
 
 
520 aa  569  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  51.59 
 
 
542 aa  568  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  54.93 
 
 
535 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>