More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3289 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3289  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
343 aa  666    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00752941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1122  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  60.34 
 
 
288 aa  306  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71976  normal  0.228753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2220  ABC-type amino acid transport system permease component-like protein  58.75 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0807  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  50.58 
 
 
327 aa  276  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.958896  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.58 
 
 
380 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.446629  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3991  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 
307 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.824823  normal  0.27555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3971  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47 
 
 
291 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2204  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.72 
 
 
296 aa  245  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27730  amino acid ABC transporter membrane protein  45.34 
 
 
287 aa  232  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.303953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2425  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.15 
 
 
291 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1788  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.67 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2153  amino acid ABC transporter permease  46.02 
 
 
292 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2199  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.02 
 
 
292 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300415  normal  0.0164217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2140  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.67 
 
 
292 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1451  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.55 
 
 
290 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.75 
 
 
294 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292475  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22710  amino acid ABC transporter membrane protein  39.87 
 
 
297 aa  202  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.04 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1244  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.3 
 
 
294 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1222  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.92 
 
 
290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312704  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15450  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine family  37.99 
 
 
295 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00524032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1495  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.11 
 
 
282 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0789  ABC transporter, permease protein  37.26 
 
 
361 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1591  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.86 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3986  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  34.04 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3522  amino acid ABC transporter permease  39.53 
 
 
293 aa  165  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0534138  normal  0.223285 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0023  amino acid ABC transporter permease  36.51 
 
 
366 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4389  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 
266 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223267  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1392  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.53 
 
 
325 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0423868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6296  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.8 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0936816  normal  0.134571 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1548  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.02 
 
 
292 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.038619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2804  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0823184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2524  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.62 
 
 
279 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3754  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
266 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36850  amino acid ABC transporter membrane protein  33.44 
 
 
288 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0547635  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1428  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.44 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30060  amino acid ABC transporter membrane protein  32.53 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.02 
 
 
240 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6372  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
252 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198232  normal  0.40329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0692  amino acid ABC transporter permease  33.61 
 
 
230 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 
492 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4547  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
251 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.139101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.76 
 
 
493 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.54 
 
 
230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.79 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2071  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.79 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.02 
 
 
235 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6370  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.3 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.62 
 
 
216 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1061  amino acid ABC transporter permease  33.19 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.958726  normal  0.719789 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2586  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.52 
 
 
256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.62 
 
 
216 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3069  amino acid ABC transporter permease  34.44 
 
 
292 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0531  ABC-type amino acid transport system, permease component  30.86 
 
 
216 aa  109  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001634 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4372  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.06 
 
 
230 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7664  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  30.74 
 
 
250 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2259  amino acid ABC transporter transmembrane protein  36.97 
 
 
230 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.06 
 
 
335 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1217  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.98 
 
 
222 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0590  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.2 
 
 
223 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0611  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.2 
 
 
223 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.12 
 
 
229 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0975784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.63 
 
 
337 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.86 
 
 
226 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00163204  normal  0.0154362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.86 
 
 
226 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0298379  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.4 
 
 
226 aa  106  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.600792  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
233 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0739  amino acid ABC transporter permease  36.32 
 
 
308 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1386  amino acid ABC transporter permease  35.5 
 
 
337 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693888  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.86 
 
 
226 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3761  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.76 
 
 
226 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000810372  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1043  amino acid ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
226 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  33.05 
 
 
319 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.24 
 
 
233 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3398  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.97 
 
 
226 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3011  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.01 
 
 
264 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.79 
 
 
216 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1366  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.71 
 
 
223 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3393  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.56 
 
 
226 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0664089  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.48 
 
 
503 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4663  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.23 
 
 
305 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0638635  normal  0.199282 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5111  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.02 
 
 
245 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013919 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0988  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.37 
 
 
222 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0830  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.95 
 
 
229 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
214 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2598  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.04 
 
 
249 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  30.21 
 
 
237 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3028  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 
226 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.3 
 
 
343 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0971  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.16 
 
 
226 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.752056  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0985  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 
226 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5242  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.09 
 
 
226 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0591  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  30.1 
 
 
285 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  31.6 
 
 
214 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0950  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 
226 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
214 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
320 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  32.52 
 
 
501 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3963  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.64 
 
 
230 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.54526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>