35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2521 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  40.4 
 
 		 1339 aa  776    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  63.21 
 
 		 1314 aa  1527    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  44.69 
 
 		 1252 aa  868    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  44.62 
 
 		 1254 aa  877    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  100 
 
 		 1287 aa  2598    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  58.51 
 
 		 1226 aa  1293    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  42.21 
 
 		 1323 aa  840    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  41.34 
 
 		 1332 aa  813    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  41.68 
 
 		 1321 aa  811    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  45.09 
 
 		 1220 aa  887    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  44.3 
 
 		 1235 aa  892    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  40.85 
 
 		 1285 aa  781    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  66.01 
 
 		 1374 aa  1545    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  45.09 
 
 		 1220 aa  887    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  37.57 
 
 		 1188 aa  634  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  35.81 
 
 		 1131 aa  561  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  35.12 
 
 		 1159 aa  552  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  34.06 
 
 		 1101 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  34.85 
 
 		 1062 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  32 
 
 		 1071 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1173 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  32.08 
 
 		 1215 aa  416  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  31.26 
 
 		 1063 aa  395  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  32.55 
 
 		 1162 aa  376  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  27.66 
 
 		 1201 aa  257  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  28.18 
 
 		 1401 aa  192  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  28.18 
 
 		 1401 aa  192  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  25.82 
 
 		 1424 aa  181  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  28.67 
 
 		 1189 aa  151  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  28.27 
 
 		 1410 aa  135  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  24.07 
 
 		 1082 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11976  hypothetical protein  37.21 
 
 		 133 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.73 
 
 		 1542 aa  51.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2637  helicase-like protein  32.98 
 
 		 1528 aa  47.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.209062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.99 
 
 		 600 aa  45.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>