More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1583 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 424 aa  884    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  46.88 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  48.67 
 
 		 420 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  48.25 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  48.51 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  45.91 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  48.22 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  44.42 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  45.06 
 
 		 420 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  47.98 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  45.19 
 
 		 421 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  44.74 
 
 		 414 aa  358  8e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  44.74 
 
 		 414 aa  358  9e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  47 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  46.39 
 
 		 419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  45.8 
 
 		 418 aa  349  5e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  48.3 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  46.25 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  43.37 
 
 		 420 aa  342  5.999999999999999e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  44.74 
 
 		 417 aa  341  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  43.13 
 
 		 420 aa  340  4e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  47.98 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  41.15 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  44.52 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  41.9 
 
 		 429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  41.9 
 
 		 394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  41.94 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  41.46 
 
 		 409 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  39.19 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  40.69 
 
 		 415 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  38 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  38.37 
 
 		 414 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 		 415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  37.87 
 
 		 414 aa  247  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  37.5 
 
 		 408 aa  236  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  33.42 
 
 		 400 aa  225  9e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  33.42 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  33.67 
 
 		 403 aa  209  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  31.04 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  32.5 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  34.81 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  29.91 
 
 		 460 aa  187  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  32.58 
 
 		 405 aa  186  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  35.88 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  32.23 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  30.95 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  31.37 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  31.54 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  32.09 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  32.01 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  28.64 
 
 		 406 aa  154  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  29.14 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  29.2 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  28.67 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  26.18 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  27.86 
 
 		 350 aa  87.4  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  27.9 
 
 		 350 aa  87  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  29.32 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  27.31 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  26.35 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  26.25 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  27.12 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  26.92 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  27.46 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  28.32 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  28.02 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  29.07 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  28.22 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  28.57 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  25.68 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  28.84 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  26.14 
 
 		 346 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  26.14 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  26.07 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  27.24 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  27.08 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  28.14 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  27.02 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  27.68 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  25.92 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  27.02 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  27.87 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  25.5 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  25.6 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  25.29 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  28.83 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  25.59 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  25.59 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  26.62 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  28.26 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  25.59 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.02 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  28.28 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  25.16 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  27.02 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  27.21 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  22.85 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>