170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1355 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  266  5.9999999999999995e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  46.34 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  45.38 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  46.28 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  40.98 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  41.94 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  40.8 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  41.13 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  41.13 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  39.52 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  42.06 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  37.7 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  42.37 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  39.83 
 
 		 147 aa  103  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  42.28 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  44 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  45.08 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  41.88 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  41.27 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  36.8 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  38.89 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  39.17 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  36.8 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  40.68 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  40.65 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  38.58 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  36.97 
 
 		 191 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  38.21 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  41.27 
 
 		 163 aa  92.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  39.84 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  40.62 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  38.1 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  37.3 
 
 		 132 aa  92  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  39.68 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  33.61 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  39.53 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  38.71 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  41.73 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  37.88 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  39.84 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  39.84 
 
 		 165 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  43.31 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  36.92 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  36.51 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  34.92 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  33.87 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  35.25 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  38.89 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  40.6 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  36.29 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  39.39 
 
 		 146 aa  87  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  35.86 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  39.2 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  39.23 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  39.2 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  39.2 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  39.2 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  39.2 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  39.2 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  41.46 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105567 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  39.2 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  39.2 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  38.06 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  35.71 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  35.97 
 
 		 175 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  35.97 
 
 		 175 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  35.94 
 
 		 163 aa  83.6  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  39.39 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  38.4 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  37.01 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1396  SecC motif-containing protein  35.92 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0319965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  37.5 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  39.2 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  39.34 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  39.2 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  37.69 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  35.71 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  35.71 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  41.27 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  39.2 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  38.41 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  39.2 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  38.28 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  36.15 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  36.5 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  38.46 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  37.4 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  36 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  37.88 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  36.72 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  37.4 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2182  hypothetical protein  36.92 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.194641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  36.64 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  35.51 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  35.38 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  35.43 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  36.09 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  36.29 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  37.21 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4362  hypothetical protein  34.11 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>