More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0781 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  72.08 
 
 		 246 aa  342  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  64.56 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  59.92 
 
 		 245 aa  281  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  49.38 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  47.21 
 
 		 244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  44.27 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  45.3 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 264 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  42.68 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  44.02 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  43.59 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  44.68 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  47.95 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  43.32 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  41.92 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  38.87 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  42.37 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  46.22 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  40.83 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  44.4 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  43.67 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.82 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  40.25 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.59 
 
 		 239 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  39.5 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  37.05 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  38.25 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.24 
 
 		 240 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 257 aa  129  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  38.83 
 
 		 195 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  38.83 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 238 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  38.08 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.43 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.22 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  38.08 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  33.77 
 
 		 232 aa  122  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  37.77 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 255 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  37.55 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.93 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>