More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0317 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0317  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  100 
 
 
214 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0665  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  71.26 
 
 
186 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4386  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  65.69 
 
 
211 aa  224  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0847  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  51.46 
 
 
213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348017  hitchhiker  0.00000000679194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0392  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  52.91 
 
 
201 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0463  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  48.08 
 
 
235 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5971  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  51.08 
 
 
206 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6657  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  51.3 
 
 
196 aa  151  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.885595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.46 
 
 
230 aa  104  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.21 
 
 
215 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.02 
 
 
215 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  42.74 
 
 
213 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  38.93 
 
 
201 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  39.74 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  34.55 
 
 
205 aa  99  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  39.07 
 
 
245 aa  99  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  34.9 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5531  NADH dehydrogenase subunit C  34.75 
 
 
412 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346603 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  40 
 
 
253 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.38 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.52 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0511  NADH dehydrogenase I chain C, D  38.96 
 
 
168 aa  96.3  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.27 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.38 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  36.69 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1871  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.61 
 
 
172 aa  95.5  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0432  NADH dehydrogenase I, C subunit  41.18 
 
 
186 aa  95.1  7e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  34.38 
 
 
202 aa  94.7  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  34.38 
 
 
202 aa  94.7  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.85 
 
 
166 aa  94.7  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.34 
 
 
182 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  42.4 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.82 
 
 
204 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  40.8 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  34.54 
 
 
200 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  44.35 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2811  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.59 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  32.07 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5178  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.5 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.75 
 
 
174 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.81 
 
 
190 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5419  NADH dehydrogenase subunit C  33.57 
 
 
421 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.25 
 
 
175 aa  92.8  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5096  NADH dehydrogenase subunit C  32.86 
 
 
485 aa  92.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.75 
 
 
309 aa  92.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4173  NADH dehydrogenase subunit J  43.69 
 
 
168 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.33 
 
 
245 aa  92.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  35.76 
 
 
229 aa  91.7  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.94 
 
 
174 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  33.75 
 
 
200 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  39.86 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1151  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.34 
 
 
169 aa  91.3  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  42.74 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  36.73 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0636  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.34 
 
 
172 aa  90.9  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.73 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  36.73 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5474  NADH dehydrogenase subunit C  36.28 
 
 
421 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  39.2 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0745  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.85 
 
 
172 aa  90.5  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4561  NADH dehydrogenase subunit C  43.31 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.8 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2991  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.88 
 
 
168 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  31.52 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6042  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.14 
 
 
163 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0449597  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2060  NADH dehydrogenase subunit C  32.79 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.072727  normal  0.101712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  39.72 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  38 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  37.01 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4998  NADH dehydrogenase subunit C  31.43 
 
 
409 aa  89  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.73 
 
 
196 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  38.35 
 
 
200 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1875  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  37.78 
 
 
207 aa  89  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.603948  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  43.24 
 
 
227 aa  88.6  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  43.24 
 
 
227 aa  88.6  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.67 
 
 
148 aa  88.6  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5423  NADH dehydrogenase subunit C  36.28 
 
 
481 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2473  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.14 
 
 
180 aa  88.2  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2090  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  38.69 
 
 
189 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0846  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.62 
 
 
175 aa  88.2  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3306  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.93 
 
 
598 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00420635  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  34.07 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  34.07 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  34.07 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  38.71 
 
 
284 aa  87.8  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1087  hypothetical protein  38.1 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1860  NADH dehydrogenase subunit J  32.09 
 
 
175 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  34.07 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  34.07 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  40.28 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  34.07 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  34.07 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1281  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.54 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3817  NADH dehydrogenase subunit C  31.43 
 
 
291 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
200 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1605  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.64 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  40.32 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3633  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.8 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>