134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2169 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  53.47 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  52.85 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  51.43 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  53.88 
 
 		 250 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  51.02 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  51.63 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  54.03 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  52.24 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  49.6 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  40.56 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  40.56 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  50.6 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  51.82 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  47.5 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  46.67 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  44.08 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  41.87 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  42.39 
 
 		 246 aa  201  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  48.36 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  42.34 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  40.25 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  38.43 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  41.22 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  36.51 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  46.28 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  30.85 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  34.04 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  40.15 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  34.04 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  34.04 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  34.04 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  42.74 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  37.41 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  37.06 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  39.69 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  34.22 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  29.52 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  41.96 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  35.51 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  37.6 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  29.75 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  29.77 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  38.76 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  35.71 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  36.64 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  36.64 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  36.64 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  39.34 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.94 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4018  methyltransferase  53.57 
 
 		 89 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000287879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  34.68 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  31.75 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  29.95 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  31.45 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  31.48 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  37.63 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  37.63 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.11 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.88 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  30.43 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.43 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  30.43 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.43 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  25.17 
 
 		 318 aa  48.9  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 275 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.42 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  32.59 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>