More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1340 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  100 
 
 		 108 aa  214  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  55.06 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  58.43 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  52.75 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  56.04 
 
 		 100 aa  97.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  65.71 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  63.01 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  51.65 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  63.77 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  54.95 
 
 		 92 aa  94.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  64.79 
 
 		 94 aa  94.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  63.77 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  63.77 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  63.77 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  63.77 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  63.77 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  63.77 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  65.22 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  56.18 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  63.77 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  57.14 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  60.87 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  63.77 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  51.65 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  63.77 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  58.11 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  58.9 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  51.95 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  50 
 
 		 94 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  53.16 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  53.33 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  60.87 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  47.25 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  54.76 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  53.25 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  47.56 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  46.24 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  39.51 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  51.56 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.75 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  50 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 816 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 871 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  37.1 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  36.05 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  46.77 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  39.68 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 890 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 872 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  37.5 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 866 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  44.07 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.76 
 
 		 925 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 		 836 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  42.11 
 
 		 565 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 849 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  39.24 
 
 		 795 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 759 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  36.92 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 759 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  36.99 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 867 aa  51.2  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  38.96 
 
 		 938 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  36.07 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  39.71 
 
 		 833 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  48.33 
 
 		 64 aa  50.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 820 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 752 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  31.43 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 750 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 		 1182 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  40.54 
 
 		 1013 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 835 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  44.62 
 
 		 561 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 887 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 1021 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 855 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  39.19 
 
 		 946 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 806 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 1021 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  42.67 
 
 		 561 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  34.29 
 
 		 744 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 797 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  32.79 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  38.16 
 
 		 1040 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 976 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 		 937 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  41.43 
 
 		 564 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  32.79 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  41.1 
 
 		 1063 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>