More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0542 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 		 490 aa  1014    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.49 
 
 		 484 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.46 
 
 		 486 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.04 
 
 		 486 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  38.46 
 
 		 476 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  38.6 
 
 		 498 aa  329  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.29 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  37.81 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.02 
 
 		 482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  38.02 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.88 
 
 		 488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  37.81 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  38.05 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  37.81 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.33 
 
 		 475 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  37.81 
 
 		 498 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  38.05 
 
 		 476 aa  324  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.66 
 
 		 486 aa  322  7e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.66 
 
 		 486 aa  322  7e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.49 
 
 		 484 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  38.66 
 
 		 486 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.07 
 
 		 480 aa  319  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  37.19 
 
 		 480 aa  319  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.8 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.67 
 
 		 475 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  37.71 
 
 		 485 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.27 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.49 
 
 		 481 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  37.24 
 
 		 484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.6 
 
 		 494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.05 
 
 		 496 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  36.16 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  38.43 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  37.73 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.7 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.67 
 
 		 587 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.5 
 
 		 477 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  38.34 
 
 		 486 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  36.38 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.83 
 
 		 477 aa  300  6e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.43 
 
 		 477 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.57 
 
 		 487 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.84 
 
 		 496 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.36 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  36.34 
 
 		 478 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.92 
 
 		 488 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.33 
 
 		 488 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  37.68 
 
 		 487 aa  293  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.96 
 
 		 448 aa  293  6e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.96 
 
 		 534 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  37.52 
 
 		 556 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.95 
 
 		 483 aa  292  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  35.17 
 
 		 492 aa  291  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  36.83 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.38 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.83 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  36.06 
 
 		 484 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.34 
 
 		 518 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  35.96 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  34.42 
 
 		 480 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  35.96 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  35.96 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  36.07 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  35.96 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  35.96 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.36 
 
 		 491 aa  290  5.0000000000000004e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  36.69 
 
 		 478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  36.11 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.11 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  36.11 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  36.11 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  36.11 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.33 
 
 		 493 aa  289  7e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  36.11 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  36.11 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  36.11 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  35.67 
 
 		 477 aa  289  8e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.48 
 
 		 482 aa  289  9e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  35.85 
 
 		 480 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.03 
 
 		 495 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  35.67 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.67 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  35.9 
 
 		 477 aa  287  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.88 
 
 		 497 aa  286  7e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.5 
 
 		 480 aa  286  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.57 
 
 		 491 aa  286  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  36.86 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.19 
 
 		 488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  37.07 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.67 
 
 		 499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  38.21 
 
 		 515 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.68 
 
 		 489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.7 
 
 		 487 aa  284  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.58 
 
 		 506 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  38.04 
 
 		 510 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  36.14 
 
 		 477 aa  283  7.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.45 
 
 		 496 aa  282  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  35.45 
 
 		 482 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.57 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  34.52 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>