139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3006 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 258 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  63.95 
 
 		 273 aa  345  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  64.17 
 
 		 266 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  62.8 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  63.18 
 
 		 267 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  62.2 
 
 		 266 aa  332  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  63.1 
 
 		 271 aa  331  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  61.81 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  61.09 
 
 		 266 aa  327  9e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  63.81 
 
 		 263 aa  323  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  48.02 
 
 		 270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  48.87 
 
 		 277 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  46.56 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  53.68 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  48 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  54.39 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  44.4 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  45.24 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  49.81 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  43.97 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  43.97 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  43.97 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  43.97 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  43.97 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  43.97 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  43.97 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  43.72 
 
 		 274 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  43.41 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  42.06 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  45.34 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  45.75 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  44.62 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  41.73 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  46.92 
 
 		 271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  49.78 
 
 		 267 aa  215  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  42.62 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  42.62 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  42.62 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  46.95 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  46.12 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  43.8 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  41.73 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  41.47 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  41.8 
 
 		 265 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  41.06 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  43.8 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  44.65 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  43.8 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  43.41 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  42.21 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  44.18 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  43.72 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  42.21 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  44.19 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  43.41 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  43.65 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  44.22 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  39.76 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  37.31 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  43.64 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  43.32 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  43.64 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  43.83 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  42.28 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  41.27 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  41.27 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  41.27 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  40.86 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  38.82 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  32.65 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  31.37 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  31.99 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  32.24 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  32.65 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  31.09 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  29.1 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  29.1 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  31.15 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  31.28 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  29.8 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  29.24 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  31.65 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  28.09 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  28.09 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  31.12 
 
 		 314 aa  98.2  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  32.35 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  31.72 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  27.35 
 
 		 296 aa  95.5  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  29.83 
 
 		 296 aa  95.5  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  29.63 
 
 		 296 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  31.44 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  30.38 
 
 		 319 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  27.91 
 
 		 321 aa  92.8  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  31.37 
 
 		 286 aa  89.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>