More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2770 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  44.07 
 
 		 823 aa  682    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2163  DNA gyrase, A subunit  42.29 
 
 		 869 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.612528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  42.24 
 
 		 857 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  43.02 
 
 		 889 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  43.14 
 
 		 893 aa  666    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  43.98 
 
 		 812 aa  657    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  44.07 
 
 		 823 aa  683    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  42.67 
 
 		 818 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  43.38 
 
 		 811 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  44.15 
 
 		 819 aa  657    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  42 
 
 		 828 aa  659    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  44.07 
 
 		 823 aa  683    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  44.07 
 
 		 823 aa  683    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  44.88 
 
 		 823 aa  685    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  43.05 
 
 		 807 aa  663    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  44.63 
 
 		 825 aa  674    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  43 
 
 		 864 aa  638    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  44.63 
 
 		 823 aa  683    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  42.91 
 
 		 848 aa  645    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  43.54 
 
 		 816 aa  670    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  43.71 
 
 		 949 aa  648    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  44.07 
 
 		 823 aa  681    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  41.39 
 
 		 834 aa  636    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  46.72 
 
 		 818 aa  705    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  44.5 
 
 		 835 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  43.4 
 
 		 836 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  42.84 
 
 		 827 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  41.97 
 
 		 828 aa  635    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  42.38 
 
 		 857 aa  648    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  43.99 
 
 		 811 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  44.07 
 
 		 823 aa  683    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  40.8 
 
 		 879 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  44.07 
 
 		 823 aa  682    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  43.88 
 
 		 901 aa  655    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  42.31 
 
 		 875 aa  664    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  43.51 
 
 		 802 aa  636    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  43.88 
 
 		 832 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  43.77 
 
 		 836 aa  663    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  44.49 
 
 		 820 aa  673    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  43.28 
 
 		 809 aa  649    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  44.57 
 
 		 821 aa  690    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  45.8 
 
 		 830 aa  675    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  41.89 
 
 		 907 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  44.75 
 
 		 823 aa  686    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  43.36 
 
 		 830 aa  641    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  43.99 
 
 		 816 aa  654    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0873  DNA gyrase, A subunit  41.9 
 
 		 899 aa  636    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218975  hitchhiker  0.00000181562 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  42.31 
 
 		 865 aa  665    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  43.43 
 
 		 839 aa  665    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  43.56 
 
 		 839 aa  668    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  42.01 
 
 		 870 aa  640    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  41.27 
 
 		 819 aa  650    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  43.02 
 
 		 812 aa  649    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  43.24 
 
 		 866 aa  649    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  42.34 
 
 		 829 aa  648    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  44.22 
 
 		 848 aa  652    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  42.35 
 
 		 817 aa  640    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2770  DNA gyrase, A subunit  100 
 
 		 823 aa  1678    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  44.07 
 
 		 796 aa  639    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1072  DNA gyrase subunit A  42.36 
 
 		 915 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  42.95 
 
 		 807 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  43.02 
 
 		 889 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  41.92 
 
 		 828 aa  636    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1021  DNA gyrase, A subunit  42.18 
 
 		 856 aa  656    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0962038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  42.93 
 
 		 853 aa  635  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  41.92 
 
 		 855 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  41.67 
 
 		 838 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0640  DNA gyrase subunit A  42.12 
 
 		 827 aa  634  1e-180  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00358145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  42 
 
 		 852 aa  632  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  41.92 
 
 		 826 aa  634  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  43.65 
 
 		 813 aa  635  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  41.65 
 
 		 843 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  43.77 
 
 		 824 aa  631  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1105  DNA gyrase subunit A  42.07 
 
 		 879 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0580579  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  42.05 
 
 		 840 aa  629  1e-179  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  43.87 
 
 		 812 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5446  DNA gyrase, A subunit  41.51 
 
 		 859 aa  631  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  42.84 
 
 		 841 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3211  DNA gyrase subunit A  42.38 
 
 		 879 aa  631  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  43.53 
 
 		 836 aa  632  1e-179  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2457  DNA gyrase subunit A  41.55 
 
 		 878 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0910619  normal  0.208896 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1142  DNA gyrase subunit A  42.52 
 
 		 858 aa  626  1e-178  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0901  DNA gyrase subunit A  41.31 
 
 		 885 aa  625  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.018045  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  40.92 
 
 		 883 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4078  DNA gyrase subunit A  41.96 
 
 		 887 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0373422  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2799  DNA gyrase subunit A  41.79 
 
 		 888 aa  627  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.107498  normal  0.540526 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0088  DNA gyrase subunit A  42.55 
 
 		 844 aa  625  1e-178  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  40.35 
 
 		 898 aa  627  1e-178  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2148  DNA gyrase subunit A  42.38 
 
 		 886 aa  625  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0598325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2616  DNA gyrase subunit A  41.55 
 
 		 878 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.341614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2512  DNA gyrase subunit A  41.55 
 
 		 878 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0982635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0738  DNA gyrase subunit A  41.33 
 
 		 859 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.958835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2408  DNA gyrase subunit A  41.55 
 
 		 878 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000367831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  42.35 
 
 		 840 aa  627  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  40.46 
 
 		 923 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  40.89 
 
 		 871 aa  625  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2846  DNA gyrase subunit A  41.95 
 
 		 897 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215176  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  40.94 
 
 		 827 aa  625  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2730  DNA gyrase, A subunit  41.85 
 
 		 819 aa  623  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  43.11 
 
 		 856 aa  625  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>