More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1438 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
356 aa  728    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
401 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
382 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  28.73 
 
 
369 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
388 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
388 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
371 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
369 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
383 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
389 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
385 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
382 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
382 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
382 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
393 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
373 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
378 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
377 aa  109  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  28.87 
 
 
745 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
367 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
385 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
390 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
373 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
407 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
379 aa  96.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
380 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
392 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
377 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
389 aa  93.2  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.52 
 
 
377 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
350 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  25.85 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.34 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  26.72 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.78 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  27.07 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  25.9 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.63 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
389 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  24.48 
 
 
393 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
371 aa  89.7  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.66 
 
 
419 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
360 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
374 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
365 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
401 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  26.91 
 
 
745 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
398 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  21.93 
 
 
384 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  23.54 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
387 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
362 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.61 
 
 
365 aa  87  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  30.87 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  26.18 
 
 
353 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  24.78 
 
 
346 aa  86.7  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
389 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
394 aa  86.3  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
364 aa  86.3  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
389 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1139  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0404734  normal  0.023827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.33 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  25.21 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.28 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  25.54 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
388 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  24.21 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  22.49 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  20.5 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
385 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  24.79 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>