More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1292 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1292  TldD/PmbA family protein  100 
 
 		 435 aa  889    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00918646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1845  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.56 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  22.03 
 
 		 473 aa  93.6  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 462 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  25 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.42 
 
 		 450 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.99 
 
 		 457 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  24.01 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3845  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.6 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  21.56 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  22.43 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  24.18 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  23.67 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.18 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  23.89 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.89 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3908  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.86 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.86 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  31.43 
 
 		 448 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.5 
 
 		 448 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  24.87 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.86 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  22.7 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.67 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  22.27 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  25.51 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  22.52 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  23.99 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.06 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5086  putative modulator of DNA gyrase  22.45 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3957  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.83 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.259063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58050  PmbA protein  22.68 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.79 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  30.86 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.89 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12740  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  28.98 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  29.26 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  22.98 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  29.44 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  29.44 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.2 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.84 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  22.94 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.01 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  29.44 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.36 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  22.94 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  22.25 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  23.01 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  22.25 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4154  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.34 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  22.27 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  23.01 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  21.95 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  21.33 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  23.01 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  23.01 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.36 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.17 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.5 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0594  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.49 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.23 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  22.55 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.24 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.65 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.65 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.65 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.69 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3821  peptidase PmbA  27.92 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1274  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.94 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.277535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  26.15 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.32 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.07 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.18 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0527  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.45 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3067  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.07 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  26.48 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.3 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  22.1 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  21.97 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.86 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6114  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.51 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.48 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  22.62 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  23.92 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  26.83 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  23.92 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  23.92 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  23.46 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0416  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.13 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.4 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.66 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4078  pmba protein  27.42 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.86 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  28.18 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.85 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  23.59 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>