More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1056 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  414  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  79.27 
 
 
361 aa  288  5.0000000000000004e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  76.56 
 
 
356 aa  287  6e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  75.25 
 
 
370 aa  270  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  74.13 
 
 
330 aa  257  8e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  76.29 
 
 
386 aa  254  7e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  64.36 
 
 
381 aa  248  5e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  68.02 
 
 
341 aa  226  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  47.73 
 
 
329 aa  130  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  42.29 
 
 
559 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  42.6 
 
 
715 aa  118  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  43.75 
 
 
263 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  39.6 
 
 
772 aa  111  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  35.59 
 
 
1104 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  37.5 
 
 
233 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  42.68 
 
 
282 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  38.42 
 
 
325 aa  104  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  38.19 
 
 
663 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  37.28 
 
 
224 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  42.17 
 
 
760 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  40.38 
 
 
245 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  40.7 
 
 
742 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  38.55 
 
 
223 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  42.5 
 
 
276 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  35.19 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  35.4 
 
 
226 aa  99  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  36.42 
 
 
225 aa  99  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  40.74 
 
 
398 aa  99  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  40 
 
 
446 aa  98.6  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  35.8 
 
 
226 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  39.24 
 
 
751 aa  97.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  37.36 
 
 
310 aa  97.1  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  37.65 
 
 
230 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  38.51 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  39.02 
 
 
293 aa  96.7  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  35.8 
 
 
214 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  34.57 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  37.42 
 
 
279 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  39.77 
 
 
1581 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  37.65 
 
 
398 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  37.36 
 
 
287 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  41.21 
 
 
826 aa  92  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  38.12 
 
 
517 aa  91.7  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  40.96 
 
 
586 aa  91.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  38.6 
 
 
475 aa  91.3  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  38.69 
 
 
829 aa  91.7  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  37.27 
 
 
288 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  38.51 
 
 
319 aa  90.1  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  42.11 
 
 
321 aa  89.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  33.16 
 
 
366 aa  89  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  39.16 
 
 
338 aa  89  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  36.88 
 
 
294 aa  89  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  39.31 
 
 
301 aa  88.6  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  39.13 
 
 
319 aa  88.2  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  36.88 
 
 
614 aa  87  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  35.8 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  35.29 
 
 
892 aa  85.9  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  35.84 
 
 
289 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  36.2 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  34.12 
 
 
1064 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  39.74 
 
 
768 aa  83.6  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  37.11 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  34.1 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  38.24 
 
 
327 aa  81.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  34.48 
 
 
359 aa  81.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  33.72 
 
 
237 aa  81.3  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  34.88 
 
 
1911 aa  81.3  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  35.63 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  39.16 
 
 
587 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  35.03 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  35.03 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  37.06 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  34.13 
 
 
740 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  41.07 
 
 
882 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  34.88 
 
 
654 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  33.54 
 
 
922 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  33.16 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  34.73 
 
 
952 aa  79.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  36.09 
 
 
862 aa  79  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  35.26 
 
 
616 aa  78.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  34.78 
 
 
377 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  34.32 
 
 
664 aa  78.6  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  34.78 
 
 
421 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  38.67 
 
 
522 aa  78.2  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  37.43 
 
 
269 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.16 
 
 
433 aa  77.8  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  39.13 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  34.12 
 
 
625 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 
617 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  35.26 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.64 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  35.44 
 
 
1132 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  35.8 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 
319 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  36.36 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  34.03 
 
 
668 aa  76.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
538 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  34.97 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  36.6 
 
 
611 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>