More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0223 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0223  50S ribosomal protein L20  100 
 
 
123 aa  247  4e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  53.78 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  51.67 
 
 
125 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  51.28 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 
133 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
117 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  49.17 
 
 
125 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 
118 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  47.93 
 
 
121 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 
118 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
121 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  48.28 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  45.3 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  47.46 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  47.06 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  47.9 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  47.06 
 
 
119 aa  118  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  48.74 
 
 
119 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  48.72 
 
 
121 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  44.92 
 
 
133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  48.74 
 
 
119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  50.43 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  117  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  49.15 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  47.01 
 
 
118 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2154  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000435469  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  46.22 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  45.76 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0715  50S ribosomal protein L20  48.62 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.884978  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  45.38 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  47.46 
 
 
134 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  47.46 
 
 
134 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  47.46 
 
 
134 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  47.06 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  47.06 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  45 
 
 
121 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  47.41 
 
 
117 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  45.76 
 
 
118 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  48.25 
 
 
117 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  47.37 
 
 
117 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  52.88 
 
 
116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  47.86 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  43.59 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0726  ribosomal protein L20  45.3 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0104067  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  43.1 
 
 
119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  48.72 
 
 
119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  45.79 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  47.86 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  46.15 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  44.74 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2355  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.030925  normal  0.100889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  48.67 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  47.06 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  43.86 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  42.86 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  44.92 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1645  50S ribosomal protein L20  48.25 
 
 
115 aa  111  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194936  normal  0.0586413 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00830  50S ribosomal protein L20  44.74 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.892905  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0562  50S ribosomal protein L20  47.17 
 
 
114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0199954 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1044  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215802  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  44.63 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1441  50S ribosomal protein L20  45.38 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 
119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0995  ribosomal protein L20  45.61 
 
 
114 aa  110  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  44.63 
 
 
121 aa  110  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  43.33 
 
 
124 aa  110  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  48.74 
 
 
119 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3153  50S ribosomal protein L20  49.06 
 
 
125 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  47.01 
 
 
134 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  47.37 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 
119 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  47.37 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  47.01 
 
 
117 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  47.01 
 
 
117 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  46.15 
 
 
119 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0027  50S ribosomal protein L20  45.61 
 
 
114 aa  110  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  47.06 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  45.3 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1910  50S ribosomal protein L20  49.51 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  45.3 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  45.3 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  45.38 
 
 
119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>