More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0726 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0726  ribosomal protein L20  100 
 
 
118 aa  231  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0104067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  55.17 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 
117 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  51.72 
 
 
121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  52.17 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
118 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 
118 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 
118 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
118 aa  123  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
118 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
118 aa  123  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
118 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
118 aa  123  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
118 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
118 aa  123  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
118 aa  123  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
118 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
118 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
118 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
118 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  55.17 
 
 
117 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
118 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
119 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1253  ribosomal protein L20  50.88 
 
 
116 aa  121  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78638  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  121  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 
119 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  52.17 
 
 
118 aa  120  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
124 aa  121  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  52.17 
 
 
117 aa  120  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  120  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
118 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
118 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  52.59 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  49.14 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
120 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
120 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 
119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  50 
 
 
126 aa  117  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  50.86 
 
 
119 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  50.43 
 
 
119 aa  117  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  117  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
119 aa  116  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  54.72 
 
 
114 aa  116  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
117 aa  116  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  115  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  57 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  51.79 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  48.28 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  48.72 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  48.28 
 
 
129 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  48.28 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  49.07 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>