More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0184 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0184  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312972  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  35.29 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  30 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  32 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  26.97 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  57  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0451  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000202528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0114  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 95 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 95 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  32.61 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  28.16 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  27.08 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0147  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000969846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  33.7 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3402  ribosomal protein S6  33 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301569  normal  0.342869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  28.74 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  26.97 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  34.88 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  38.1 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>