More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13954 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  63.55 
 
 		 227 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  63.11 
 
 		 227 aa  262  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  62.38 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  62.38 
 
 		 225 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  62.38 
 
 		 225 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  54.63 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  56.19 
 
 		 205 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  49.76 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  48.61 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  54.82 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  54.31 
 
 		 213 aa  191  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  51.96 
 
 		 245 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  50.23 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  47.27 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  52.06 
 
 		 210 aa  178  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  48.83 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  45.83 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  48.61 
 
 		 306 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  46.67 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  48.48 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  47.37 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  53.14 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  50.22 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  46.08 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  56.6 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  47.89 
 
 		 262 aa  158  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  46.46 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  48.42 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  43.27 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  56.77 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  47.9 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  44.44 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  42.02 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  41 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  31.92 
 
 		 255 aa  118  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  42.94 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  32.86 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  32.12 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  35.76 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  32.2 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  39.29 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  31.79 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  41.45 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  30.32 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  33.54 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  33.77 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  33.77 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  33.77 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  35.61 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  35.61 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  28.31 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  32.91 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  36.6 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  37.32 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  33.55 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  31.36 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  28.74 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  33.76 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  35.23 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  34.38 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  35.97 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  36.43 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  32.28 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  32.28 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  28.85 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  40 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  32.28 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  36.18 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  32.28 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  35.46 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  32.28 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  39.86 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  34.85 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  32.34 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  39.32 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  26.24 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  42.24 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  38.07 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  31.72 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  34.88 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  34.88 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  34.88 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  34.88 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>