48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13688 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  100 
 
 		 266 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  65.9 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  65.9 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  65.9 
 
 		 261 aa  214  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  65.32 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  68.21 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  42.79 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  40 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  42.93 
 
 		 264 aa  92.4  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  44.76 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  39.66 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  32.32 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  38.01 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  27.37 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  30.62 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  36.27 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  33.95 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  39.05 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  25 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 320 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  27.93 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  40 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  25.84 
 
 		 321 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  25.81 
 
 		 326 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  25.39 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 320 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  22.46 
 
 		 321 aa  48.9  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  34.88 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  36.63 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  24.88 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 329 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  26.39 
 
 		 325 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  22.68 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  37.5 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0609  type II secretion system protein  22.38 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  34.36 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  25.84 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  29.5 
 
 		 325 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  25 
 
 		 321 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>