119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13668 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13668  transposase  100 
 
 
166 aa  337  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0360997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12957  transposase  63.58 
 
 
413 aa  210  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2580  integrase catalytic region  62.35 
 
 
408 aa  208  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0415627  normal  0.0862482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0482  integrase catalytic subunit  60.84 
 
 
419 aa  202  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239573  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1024  integrase catalytic region  61.11 
 
 
408 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1591  integrase catalytic region  61.11 
 
 
408 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1968  integrase catalytic region  61.11 
 
 
408 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2854  integrase catalytic region  61.11 
 
 
408 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3160  integrase catalytic region  61.11 
 
 
408 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4926  integrase catalytic region  61.11 
 
 
408 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409648  normal  0.357662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0578  integrase, catalytic region  62.77 
 
 
145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3040  Integrase catalytic region  57.76 
 
 
421 aa  163  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000772165  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2579  Integrase catalytic region  47.73 
 
 
428 aa  150  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25730  integrase family protein  50.31 
 
 
333 aa  147  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3900  integrase catalytic subunit  46.63 
 
 
405 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1024  Integrase catalytic region  46.43 
 
 
430 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.669349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3701  Integrase catalytic region  53.09 
 
 
407 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3601  Integrase catalytic region  53.09 
 
 
407 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000351603  normal  0.0699896 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3280  transposase  27.21 
 
 
363 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2468  integrase catalytic subunit  29.93 
 
 
514 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  29.76 
 
 
449 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  29.76 
 
 
449 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  30.71 
 
 
434 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  30.71 
 
 
434 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  29.37 
 
 
506 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  29.46 
 
 
502 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  29.46 
 
 
502 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  28.68 
 
 
502 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  28.68 
 
 
507 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  29.46 
 
 
502 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  29.46 
 
 
502 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  30.08 
 
 
507 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  30.08 
 
 
507 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  29.46 
 
 
502 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  28.68 
 
 
502 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  28.68 
 
 
502 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  31.01 
 
 
429 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  31.01 
 
 
429 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  31.01 
 
 
429 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  30.95 
 
 
523 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  32.03 
 
 
425 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  32.03 
 
 
425 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  32.03 
 
 
425 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  28.68 
 
 
502 aa  51.6  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 
507 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 
514 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3596  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  30.95 
 
 
410 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  32.03 
 
 
425 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  28.12 
 
 
494 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  28.12 
 
 
494 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  28.12 
 
 
494 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  28.12 
 
 
494 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  28.38 
 
 
502 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  29.92 
 
 
496 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  39.34 
 
 
502 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  29.84 
 
 
497 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
501 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  29.84 
 
 
468 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
501 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
501 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
501 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
501 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
501 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
501 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  29.82 
 
 
507 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
423 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  29.13 
 
 
496 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  29.13 
 
 
496 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  29.13 
 
 
496 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
501 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  40.35 
 
 
499 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  40.35 
 
 
499 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  40.35 
 
 
499 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  30.56 
 
 
427 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  30.56 
 
 
427 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  30.56 
 
 
427 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  30.56 
 
 
427 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  30.56 
 
 
427 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  30.56 
 
 
427 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  30.56 
 
 
427 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  30.56 
 
 
427 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  30.56 
 
 
427 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  36.92 
 
 
496 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  27.82 
 
 
503 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  27.82 
 
 
503 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  27.82 
 
 
503 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  40.35 
 
 
499 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  40.35 
 
 
499 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  40.35 
 
 
499 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  40.35 
 
 
499 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  40.35 
 
 
499 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5105  hypothetical protein  28.57 
 
 
290 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  40.35 
 
 
499 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  32.37 
 
 
416 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  32.37 
 
 
435 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0010  transposase, IS21 family  28.35 
 
 
496 aa  44.3  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  27.59 
 
 
498 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  27.43 
 
 
512 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  27.43 
 
 
512 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0240231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>