More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4926 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1591  integrase catalytic region  100 
 
 
408 aa  825    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1024  integrase catalytic region  100 
 
 
408 aa  825    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3160  integrase catalytic region  100 
 
 
408 aa  825    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2854  integrase catalytic region  100 
 
 
408 aa  825    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4926  integrase catalytic region  100 
 
 
408 aa  825    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409648  normal  0.357662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2580  integrase catalytic region  85.54 
 
 
408 aa  715    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0415627  normal  0.0862482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1968  integrase catalytic region  100 
 
 
408 aa  825    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3040  Integrase catalytic region  70.12 
 
 
421 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000772165  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12957  transposase  58.97 
 
 
413 aa  485  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0482  integrase catalytic subunit  59.95 
 
 
419 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239573  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1024  Integrase catalytic region  54.13 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.669349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2579  Integrase catalytic region  54.22 
 
 
428 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3900  integrase catalytic subunit  50.61 
 
 
405 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3601  Integrase catalytic region  50.5 
 
 
407 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000351603  normal  0.0699896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3701  Integrase catalytic region  50.5 
 
 
407 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25730  integrase family protein  50.9 
 
 
333 aa  309  6.999999999999999e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2245  IS1533 transposase  60.32 
 
 
264 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0270795  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13668  transposase  61.11 
 
 
166 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0360997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0578  integrase, catalytic region  58.7 
 
 
145 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13667  transposase  60.91 
 
 
115 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0362763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  31.01 
 
 
496 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  30.94 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  30.64 
 
 
449 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  30.64 
 
 
449 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0010  transposase, IS21 family  30.95 
 
 
496 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  30.75 
 
 
496 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  30.75 
 
 
496 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  30.75 
 
 
496 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2468  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
514 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  29.33 
 
 
491 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  29.33 
 
 
491 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  29.33 
 
 
491 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  29.33 
 
 
491 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  29.33 
 
 
491 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  29.33 
 
 
491 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  29.33 
 
 
491 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  29.33 
 
 
491 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  29.33 
 
 
491 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  29.33 
 
 
491 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  29.05 
 
 
491 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  29.61 
 
 
489 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  29.05 
 
 
491 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  29.3 
 
 
427 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  29.3 
 
 
427 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  29.3 
 
 
427 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  29.3 
 
 
427 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  29.3 
 
 
427 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  29.3 
 
 
427 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  29.3 
 
 
427 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  29.3 
 
 
427 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  29.3 
 
 
427 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  30.79 
 
 
340 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  31.75 
 
 
340 aa  106  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  31.11 
 
 
338 aa  106  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  29.75 
 
 
502 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  29.5 
 
 
502 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  29.5 
 
 
502 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  29.25 
 
 
502 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  31.11 
 
 
340 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  29.5 
 
 
502 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  29.5 
 
 
502 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  26.77 
 
 
412 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  29.5 
 
 
502 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  26.65 
 
 
412 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  26.65 
 
 
412 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  26.65 
 
 
412 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>