More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3701 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3601  Integrase catalytic region  100 
 
 		 407 aa  811    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000351603  normal  0.0699896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3701  Integrase catalytic region  100 
 
 		 407 aa  811    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25730  integrase family protein  67.17 
 
 		 333 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3900  integrase catalytic subunit  51.37 
 
 		 405 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2580  integrase catalytic region  51.25 
 
 		 408 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0415627  normal  0.0862482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0482  integrase catalytic subunit  50.49 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2579  Integrase catalytic region  49.18 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1024  integrase catalytic region  50.5 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1968  integrase catalytic region  50.5 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2854  integrase catalytic region  50.5 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1591  integrase catalytic region  50.5 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4926  integrase catalytic region  50.5 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409648  normal  0.357662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3160  integrase catalytic region  50.5 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1024  Integrase catalytic region  49.13 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.669349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12957  transposase  48.78 
 
 		 413 aa  361  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3040  Integrase catalytic region  51.25 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000772165  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2245  IS1533 transposase  48.36 
 
 		 264 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0270795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13668  transposase  53.09 
 
 		 166 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0360997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0578  integrase, catalytic region  55.97 
 
 		 145 aa  136  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  30.02 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  30.02 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  26.46 
 
 		 434 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  26.46 
 
 		 434 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 502 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 502 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 502 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  29.85 
 
 		 502 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  29.85 
 
 		 502 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 502 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  29.58 
 
 		 502 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  29.44 
 
 		 507 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  28.97 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  28.97 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  28.97 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  28.97 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  28.97 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  28.97 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  28.97 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  28.97 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  28.97 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  29.3 
 
 		 502 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 510 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 510 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 510 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 510 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 510 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  28.53 
 
 		 510 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  28.25 
 
 		 512 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  28.25 
 
 		 512 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13667  transposase  50.46 
 
 		 115 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0362763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  27.43 
 
 		 496 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  27.2 
 
 		 496 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  27.2 
 
 		 496 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  27.2 
 
 		 496 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  26.81 
 
 		 429 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  26.81 
 
 		 429 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  26.81 
 
 		 429 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  28.85 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  29.14 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0010  transposase, IS21 family  26.91 
 
 		 496 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0788  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 282 aa  87  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00612306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0638  Integrase catalytic region  26.13 
 
 		 504 aa  86.7  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316321  normal  0.0202803 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  27.93 
 
 		 338 aa  86.3  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7663  integrase catalytic region  29.64 
 
 		 348 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  28.95 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  28.47 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  28.81 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  28.47 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  25.42 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  25.42 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  28.47 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  27.1 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  28.81 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0922  Integrase catalytic region  27.71 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1254  Integrase catalytic region  27.71 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0110629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  28.81 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1258  Integrase catalytic region  27.71 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135113  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1008  Integrase catalytic region  27.71 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0942  Integrase catalytic region  27.71 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0280852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1246  Integrase catalytic region  27.71 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  28.34 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1999  Integrase catalytic region  27.71 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  28.91 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  28.91 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  28.91 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  28.52 
 
 		 610 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  24.65 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  24.65 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  24.65 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  28.85 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  27.84 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  27.84 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  27.84 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  27.84 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  28.52 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  27.84 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  27.84 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  27.84 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>