More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13363 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13363  sugar-transport integral membrane protein sugI  100 
 
 
502 aa  975    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0365125  normal  0.911319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2048  sugar transporter  54.68 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  34.68 
 
 
474 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  34.19 
 
 
477 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  33.64 
 
 
480 aa  232  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  36.02 
 
 
492 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  34.76 
 
 
452 aa  227  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  33.93 
 
 
448 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  32.65 
 
 
465 aa  221  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  34.8 
 
 
472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  35.17 
 
 
507 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  30.26 
 
 
476 aa  215  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.11 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.11 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.11 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.11 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  33.56 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.11 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  32.66 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  32.66 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  32.66 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  32.66 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  32.66 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  32.66 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  32.66 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  32.66 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  32.08 
 
 
480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  32.72 
 
 
464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  32.35 
 
 
463 aa  213  9e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  32.35 
 
 
463 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  31.41 
 
 
468 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  35.13 
 
 
449 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  31.76 
 
 
471 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  32.74 
 
 
472 aa  209  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  32.74 
 
 
472 aa  209  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  32.36 
 
 
472 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  31.72 
 
 
438 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  32.58 
 
 
472 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  32.58 
 
 
472 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  32.58 
 
 
472 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  32.58 
 
 
472 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  33.41 
 
 
472 aa  206  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  34.8 
 
 
457 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  33.03 
 
 
472 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  32.36 
 
 
472 aa  205  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  32.81 
 
 
472 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  32.81 
 
 
472 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  32.81 
 
 
472 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  32.81 
 
 
472 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  34.09 
 
 
491 aa  204  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  31.39 
 
 
448 aa  199  9e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  32.8 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  30.94 
 
 
446 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  30.95 
 
 
472 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  30.8 
 
 
475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  34.91 
 
 
468 aa  197  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  33.47 
 
 
509 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  31.75 
 
 
482 aa  193  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  30.85 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  30.62 
 
 
533 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  33.18 
 
 
430 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  32.03 
 
 
458 aa  188  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  29.62 
 
 
444 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2375  sugar transporter  36.22 
 
 
489 aa  187  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00427288  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  31.72 
 
 
464 aa  186  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  29.71 
 
 
480 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  30.43 
 
 
485 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  27.89 
 
 
522 aa  183  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  30.99 
 
 
544 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02465  hypothetical protein  31.03 
 
 
792 aa  182  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  29.22 
 
 
482 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  28.73 
 
 
484 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  31.59 
 
 
466 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  31.36 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  31.36 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  31.36 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  30.84 
 
 
437 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  30.04 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  32.95 
 
 
516 aa  179  7e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  31.64 
 
 
447 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  31.55 
 
 
443 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  30.77 
 
 
443 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08912  myo-inositol transporter (AFU_orthologue; AFUA_2G07910)  29.09 
 
 
528 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  27.74 
 
 
491 aa  177  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00020  myo-inositol transporter, putative  29.61 
 
 
545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  27.54 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  27.54 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  29.09 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  28.35 
 
 
466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  31.07 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  27.54 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  27.54 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  27.54 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  32.83 
 
 
482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02585  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05190)  30.19 
 
 
499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.253437 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  27.54 
 
 
491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  31.26 
 
 
450 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  30.37 
 
 
480 aa  173  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  29.05 
 
 
452 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  29.05 
 
 
452 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>