161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13155 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13155  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  530  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.955423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2549  UspA domain-containing protein  41.91 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  42.08 
 
 
274 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12065  hypothetical protein  41.51 
 
 
279 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4127  hypothetical protein  41.29 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4202  UspA domain-containing protein  41.29 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4358  UspA domain-containing protein  41.29 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  36.16 
 
 
272 aa  125  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  39.06 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  38.33 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  38.66 
 
 
299 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4995  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
288 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  35.41 
 
 
279 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  35.04 
 
 
279 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 
279 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  32.61 
 
 
295 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4991  UspA domain-containing protein  43.13 
 
 
266 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  34.57 
 
 
294 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  33.83 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.18 
 
 
341 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.76 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.8 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.72 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  31.88 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.3 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  31 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  31 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  31 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  28.83 
 
 
246 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  31.82 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  35.39 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  30.04 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  30.11 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  31.87 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  31.32 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  35.47 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  32.33 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.05 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  30.22 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  35.2 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.61 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  32.09 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  31.56 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  29.06 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  32.67 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  32.31 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1381  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.936765  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  34.52 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.64 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.21 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  30.08 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 
291 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.35 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  29.18 
 
 
288 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  31.74 
 
 
286 aa  62.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  31.88 
 
 
283 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  34.57 
 
 
305 aa  62.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 
296 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  27.59 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  31.34 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  29.78 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  29.96 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  28.27 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.81 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  31.28 
 
 
292 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
289 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  36.88 
 
 
324 aa  59.3  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 
289 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  32.61 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  32.96 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  30.27 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  29.67 
 
 
287 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  32.99 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  30.46 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  35.06 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  34.97 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  35.07 
 
 
144 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 
290 aa  52.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 
297 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  30.57 
 
 
229 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>