151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2186 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2186  Na+/H+-exchanging protein  100 
 
 		 545 aa  1044    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.601594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2353  hypothetical protein  62.01 
 
 		 541 aa  598  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  60.93 
 
 		 543 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3197  sodium/hydrogen exchanger  35.75 
 
 		 391 aa  213  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000344959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0193  sodium/hydrogen exchanger  36.89 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  32.93 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1529  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3111  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000824463  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40732  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  25.68 
 
 		 391 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00131155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 		 608 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 		 601 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  30.08 
 
 		 611 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  30.08 
 
 		 611 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 		 602 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 		 601 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  24.88 
 
 		 596 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  24.71 
 
 		 597 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30420  predicted protein  29.06 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  29.89 
 
 		 601 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  26.82 
 
 		 598 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  24.04 
 
 		 597 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  23.8 
 
 		 597 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  28.48 
 
 		 538 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  23.11 
 
 		 597 aa  70.5  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  22.42 
 
 		 610 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 		 760 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  22.94 
 
 		 608 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 		 617 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 		 637 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  25 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  26.44 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  23.5 
 
 		 612 aa  67.4  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  25.96 
 
 		 602 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  26.8 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  26.06 
 
 		 619 aa  63.9  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.11 
 
 		 666 aa  63.9  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.38 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  25 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  19.55 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  24.71 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 		 611 aa  59.3  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1574  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 		 574 aa  58.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  27.33 
 
 		 637 aa  57.4  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 		 490 aa  57  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 		 670 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 		 673 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 		 719 aa  56.6  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  22.95 
 
 		 751 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  25.77 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  24.34 
 
 		 599 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  24.42 
 
 		 431 aa  55.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.58 
 
 		 386 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 		 622 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  25.32 
 
 		 572 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  26.43 
 
 		 617 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  24.47 
 
 		 629 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 		 670 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  25.88 
 
 		 598 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  26.38 
 
 		 624 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  25.32 
 
 		 624 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 652 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  24.8 
 
 		 593 aa  54.7  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 652 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0895  sodium/hydrogen exchanger  32.06 
 
 		 420 aa  54.7  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  28.06 
 
 		 628 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  23.77 
 
 		 616 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.76 
 
 		 669 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  24.7 
 
 		 597 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  23.77 
 
 		 607 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  23.9 
 
 		 485 aa  51.6  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  24.13 
 
 		 764 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  24.87 
 
 		 573 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  23.49 
 
 		 596 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  23.96 
 
 		 509 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  24.13 
 
 		 763 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  23.23 
 
 		 527 aa  50.8  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 		 639 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  25.23 
 
 		 492 aa  50.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 		 741 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  26.91 
 
 		 501 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  24.83 
 
 		 592 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 		 625 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.96 
 
 		 596 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  23.9 
 
 		 610 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.96 
 
 		 596 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  21.43 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 		 641 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  28.57 
 
 		 142 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.63 
 
 		 578 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.7 
 
 		 596 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.7 
 
 		 596 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  32.79 
 
 		 498 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  23.66 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>