94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1087 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1087  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  670    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000930437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.14 
 
 		 319 aa  362  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 		 317 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.68 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  49.04 
 
 		 318 aa  342  5.999999999999999e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.63 
 
 		 315 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.86 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.12 
 
 		 315 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0116647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  41.12 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06081  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.81 
 
 		 327 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  41.67 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18351  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.59 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.279534 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  39.56 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  41.36 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  39.38 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  39.38 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.02 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06471  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.43 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00302715  hitchhiker  0.000000109049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  30.59 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  30.17 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.14 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11128  cholesterol dehydrogenase  25 
 
 		 370 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1069  putative GDP-D-mannose dehydratase  30.3 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2297  GDP-D-mannose dehydratase, putative  30.3 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0531  putative GDP-D-mannose dehydratase  30.3 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3293  WcbK  30.3 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3279  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  30.3 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2175  putative GDP-D-mannose dehydratase  30.3 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3244  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  30.3 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865539  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1504  NAD dependent protein  23.76 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.526116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.21 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  25.43 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1368  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.14 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4056  dehydrogenase, putative  23.73 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.33 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.53 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.63 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.58 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3741  hypothetical protein  25.45 
 
 		 470 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  21.63 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.9 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  26.42 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.23 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2000  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.86 
 
 		 357 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002734  UDP-glucose 4-epimerase  25.43 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106036  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 506 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4932  putative oxidoreductase  23.63 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.86 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.02 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  32.43 
 
 		 1449 aa  43.5  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  23.37 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 		 372 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2107  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.7 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0520  NAD-dependent dehydratase/epimerase  25.4 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2505  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.7 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000697027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  25.71 
 
 		 2439 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.97 
 
 		 366 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  25.77 
 
 		 257 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.04 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.3 
 
 		 332 aa  42.4  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>