56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0838 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 365 aa  748    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  71.39 
 
 		 362 aa  531  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  68.72 
 
 		 362 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  58.54 
 
 		 367 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  57.98 
 
 		 367 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  58.03 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  56.3 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  57.46 
 
 		 356 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  56.86 
 
 		 367 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  56.62 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  54.87 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  53.83 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  56.42 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  58.36 
 
 		 323 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  57.45 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  53.39 
 
 		 379 aa  371  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  49.06 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  46.09 
 
 		 374 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  44.02 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  42.73 
 
 		 356 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  25.78 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  25.78 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  25.76 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  24.69 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  23.36 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  22.12 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  24.03 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  23.01 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6000  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  23.12 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 421 aa  49.7  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  23.53 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1727  hypothetical protein  23.83 
 
 		 421 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  27.2 
 
 		 618 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  19.61 
 
 		 290 aa  43.9  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  22.06 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>