95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0535 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0535  photosystem I subunit VII  100 
 
 		 81 aa  168  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.966086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0454  photosystem I subunit VII  96.3 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4980  photosystem I subunit VII  97.53 
 
 		 81 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0171  photosystem I subunit VII  96.3 
 
 		 99 aa  164  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1741  photosystem I subunit VII  96.3 
 
 		 81 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1307  photosystem I subunit VII  96.3 
 
 		 81 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1278  photosystem I subunit VII  96.3 
 
 		 81 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0127  photosystem I subunit VII  96.3 
 
 		 91 aa  163  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.409793  hitchhiker  0.00279555 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18171  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 		 81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.102176  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18001  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 		 81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17951  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 		 81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.028019  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20591  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 		 81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.594482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1184  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 		 81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00269057  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17321  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 		 81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3484  photosystem I subunit VII  93.83 
 
 		 81 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882203  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5219  photosystem I iron-sulfur protein PsaC  93.83 
 
 		 81 aa  161  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1700  photosystem I subunit VII  93.83 
 
 		 81 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26051  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 		 81 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.71 
 
 		 327 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  36.76 
 
 		 318 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.33 
 
 		 840 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 		 369 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.81 
 
 		 316 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  40 
 
 		 509 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  35.59 
 
 		 540 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.59 
 
 		 540 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  42.86 
 
 		 507 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  37.7 
 
 		 500 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  39.34 
 
 		 500 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  39.34 
 
 		 500 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.73 
 
 		 404 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1358  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.09 
 
 		 310 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  42.59 
 
 		 275 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.7 
 
 		 500 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1388  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0307097  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09770  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase, homodimeric  37.18 
 
 		 1183 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 431 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00640  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  38.98 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000382755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  38.33 
 
 		 634 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  40.68 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  43.33 
 
 		 277 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 378 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0084  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0376016  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  31.58 
 
 		 509 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.86 
 
 		 331 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.2 
 
 		 427 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.24 
 
 		 71 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2068  electron transport complex protein RnfC  33.85 
 
 		 870 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  35.59 
 
 		 509 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.65 
 
 		 987 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2143  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  34.12 
 
 		 1180 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.955322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2612  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.85 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.85 
 
 		 374 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.34 
 
 		 397 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4302  cytochrome b/b6-like  34 
 
 		 535 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103507  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 368 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  37.74 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.62 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5008  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.93 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2321  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.85 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157203  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.98 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2326  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000130298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.62 
 
 		 979 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.59 
 
 		 989 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 394 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.62 
 
 		 979 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.62 
 
 		 979 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.59 
 
 		 989 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1811  ferredoxin  33.33 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  30.43 
 
 		 423 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.21 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112658  normal  0.013412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  36 
 
 		 989 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 589 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00580  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  37.29 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00222598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0307  electron transport complex protein  33.9 
 
 		 213 aa  40  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0536  electron transport complex protein RnfC  31.51 
 
 		 773 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000392819  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1884  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.9 
 
 		 213 aa  40  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1469  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 87 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>