More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0449 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 428 aa  876    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  68.38 
 
 		 427 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  68.15 
 
 		 427 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 430 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  65.49 
 
 		 426 aa  612  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  66.59 
 
 		 424 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  62.91 
 
 		 426 aa  588  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0573  seryl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1791  seryl-tRNA synthetase  66.19 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.985996  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3523  seryl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06061  seryl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 425 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.152224 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12751  seryl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 442 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611136 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0807  seryl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16621  seryl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.897711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13811  seryl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13891  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 425 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1289  seryl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13601  seryl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 421 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 424 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 420 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 424 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 423 aa  435  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 423 aa  438  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 424 aa  431  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 422 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 425 aa  431  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 425 aa  425  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  49.17 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 421 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 421 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 425 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 426 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 442 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 423 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 421 aa  411  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 469 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 426 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 426 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>