77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4476 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  297  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  92.96 
 
 		 142 aa  281  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  78.17 
 
 		 143 aa  235  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  74.65 
 
 		 151 aa  235  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  72.54 
 
 		 152 aa  226  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  72.54 
 
 		 142 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  66.44 
 
 		 146 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  65.28 
 
 		 146 aa  200  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  73.33 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  70.49 
 
 		 146 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  72.5 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  72.5 
 
 		 147 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  60.96 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  69.92 
 
 		 141 aa  189  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  41.51 
 
 		 689 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 688 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33.68 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  34.83 
 
 		 363 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2035  rhodanese domain-containing protein  27.69 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 377 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  31.68 
 
 		 670 aa  51.6  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2303  rhodanese-like protein  34.33 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.788958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2215  rhodanese-like protein  33.85 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.636017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  32.47 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  25.53 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  25.53 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  26.85 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  31.71 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  29.85 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  29.25 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.53 
 
 		 389 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  30.93 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  31.51 
 
 		 406 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 		 454 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30 
 
 		 247 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  30.38 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  30.38 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  25.93 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  26.92 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  31.51 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  31.87 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  32.93 
 
 		 166 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  31.87 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  31.87 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  26.95 
 
 		 176 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 		 220 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  30.53 
 
 		 353 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  24.29 
 
 		 167 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  30.19 
 
 		 135 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  31.58 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  27.43 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  29.47 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  27.88 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  27.07 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  26.13 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  27.07 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  27.07 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  27.52 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  28.09 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  28.09 
 
 		 146 aa  40  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>