264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3760 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  360  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  67.8 
 
 		 177 aa  258  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  64.97 
 
 		 177 aa  243  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  63.84 
 
 		 178 aa  241  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  55.93 
 
 		 181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  55.62 
 
 		 181 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.8 
 
 		 176 aa  208  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  44.32 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  44.32 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.75 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  43.18 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  42.05 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  43.04 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  43.48 
 
 		 390 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  42.53 
 
 		 173 aa  134  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  42.41 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  38.6 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  38.86 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.91 
 
 		 178 aa  130  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  37.14 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  39.18 
 
 		 180 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  38.6 
 
 		 207 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  37.14 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.88 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.18 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  37.64 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  43.45 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.29 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  41.89 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  64 
 
 		 75 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  40.27 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.04 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.94 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  33.52 
 
 		 194 aa  97.8  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  35.17 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  35.17 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.98 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  35.62 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.55 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  38.85 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  36.49 
 
 		 176 aa  94.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  37.11 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.3 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  32.88 
 
 		 177 aa  90.9  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.17 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.81 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  35.96 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  34.46 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.58 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.89 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  34.46 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  35.14 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  35.14 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  35.14 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  35.81 
 
 		 173 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  32.96 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  33.78 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  33.79 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.46 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  33.78 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.53 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.6 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.21 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  32.21 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  34.19 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  33.12 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  32.24 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.21 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  30.98 
 
 		 193 aa  77.4  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.95 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.92 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.72 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  28.72 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.19 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.29 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  32.89 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.07 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  29.44 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.7 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  31.45 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.27 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.27 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.05 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.12 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  27.67 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  30 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.07 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  29.21 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>