40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06432 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 75 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  77.33 
 
 		 178 aa  120  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  64 
 
 		 178 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  61.33 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  61.33 
 
 		 181 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  57.33 
 
 		 177 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.33 
 
 		 181 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52 
 
 		 176 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.89 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  47.89 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  50 
 
 		 183 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  46.48 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  45.07 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  40.85 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  42.65 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  38.03 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  39.44 
 
 		 390 aa  62  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  39.44 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  42.25 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  36.62 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  38.03 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  38.03 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.44 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  45.83 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  45.83 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.62 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.39 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  36.62 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  36 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 184 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  31.51 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  31.51 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28 
 
 		 176 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  29.58 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  32.89 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 		 217 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.43 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>