67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3584 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  87.79 
 
 		 307 aa  487  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  76.24 
 
 		 304 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  78.74 
 
 		 308 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  70.82 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  71.57 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  70.9 
 
 		 308 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  70.9 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  69.93 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.57 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  71.95 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  72.24 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  72.58 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  70.45 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  53.45 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  53.1 
 
 		 302 aa  278  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  51.2 
 
 		 301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  51.21 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  48.1 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  50 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.8 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  44.83 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.75 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.49 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  45.39 
 
 		 287 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  28.09 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  25.26 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  26.67 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  27.31 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.67 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  22.68 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  26.37 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  27.66 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  23.17 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  23.17 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  27.16 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  24.88 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  25 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  27.03 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 		 335 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  23.98 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  23.16 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  24.88 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.63 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  29.32 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  24.22 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  22.42 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0315  hypothetical protein  27.1 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  24.86 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  23.35 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.22 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  24.86 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  29.32 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  24.81 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  29.32 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  29.32 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  24.86 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  29.32 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  29.73 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  29.32 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>