More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3003 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  70.12 
 
 		 182 aa  260  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  66.87 
 
 		 174 aa  254  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  63.28 
 
 		 174 aa  240  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.48 
 
 		 174 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.48 
 
 		 174 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.14 
 
 		 188 aa  217  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  39.88 
 
 		 175 aa  154  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  40.74 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  36.77 
 
 		 170 aa  134  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  39.6 
 
 		 152 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  41.45 
 
 		 183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  36.42 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  40.29 
 
 		 187 aa  118  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  35.8 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.75 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  35.8 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  34.55 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  35.19 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  34.81 
 
 		 184 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  34.18 
 
 		 184 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  34.18 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  27.33 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  33.54 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  31.45 
 
 		 223 aa  100  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  36.5 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  32.48 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.45 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  26.22 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  29.75 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.51 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  39.64 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.57 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  25.17 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  26.11 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.5 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  22.95 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  26.09 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  26.19 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  28.83 
 
 		 109 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  28.18 
 
 		 109 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  24.56 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  28.32 
 
 		 109 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  27.78 
 
 		 105 aa  53.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  25.89 
 
 		 105 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  26.61 
 
 		 109 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  27.36 
 
 		 107 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  27.03 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  33.65 
 
 		 238 aa  51.6  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  28.04 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.31 
 
 		 238 aa  51.6  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  31 
 
 		 105 aa  51.2  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  26.42 
 
 		 102 aa  51.2  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0945  thioredoxin domain-containing protein  26.27 
 
 		 109 aa  51.2  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  28.04 
 
 		 109 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  24.3 
 
 		 104 aa  51.2  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  32.41 
 
 		 104 aa  50.8  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  29.91 
 
 		 110 aa  51.2  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  28.04 
 
 		 116 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  26.17 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  27.36 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  29.25 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0160  thioredoxin-related  28.32 
 
 		 111 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  26.85 
 
 		 107 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  24.56 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  26.13 
 
 		 105 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  27.73 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  26.85 
 
 		 107 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  31.48 
 
 		 104 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  27.36 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  31.48 
 
 		 104 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  25.61 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  27.36 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  26.85 
 
 		 107 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  25.31 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  25 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  26.85 
 
 		 107 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  26.36 
 
 		 109 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  26.85 
 
 		 107 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  25 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  30.34 
 
 		 107 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  27.93 
 
 		 107 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  26.52 
 
 		 422 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  29.13 
 
 		 104 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  25.23 
 
 		 106 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1410  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  25.22 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459055  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  28.3 
 
 		 107 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  25.23 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  29.69 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  27.36 
 
 		 104 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  25 
 
 		 105 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  26.32 
 
 		 114 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  26.32 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.37 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  27.66 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  24.77 
 
 		 104 aa  48.5  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12893  soluble secreted antigen mpt53 precursor  26.09 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.95 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>