More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1116 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 408 aa  799    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  86.27 
 
 		 408 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  80.2 
 
 		 409 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  79.46 
 
 		 409 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  79.46 
 
 		 409 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  78.77 
 
 		 412 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  79.1 
 
 		 416 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  79.1 
 
 		 416 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  77.48 
 
 		 416 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  77.48 
 
 		 416 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  78.36 
 
 		 416 aa  623  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  76.72 
 
 		 420 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  74.51 
 
 		 408 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  67.08 
 
 		 419 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  66.09 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  67.34 
 
 		 419 aa  532  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0737  proton/glutamate symporter  71.11 
 
 		 252 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  39.85 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  38.48 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  39.6 
 
 		 440 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  39.6 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  39.59 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  39.34 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  39.35 
 
 		 433 aa  288  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  39.59 
 
 		 444 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  39.59 
 
 		 444 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  39.59 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  39.44 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  37.98 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  38.7 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  39.09 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.76 
 
 		 411 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  36.52 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.52 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  36.52 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  40.5 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  36.52 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  37.36 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  35.96 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  35.96 
 
 		 411 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  37.23 
 
 		 434 aa  263  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  41.38 
 
 		 410 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  36.32 
 
 		 411 aa  262  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  36.88 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  37.87 
 
 		 437 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  36.21 
 
 		 411 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  35.78 
 
 		 411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  36.03 
 
 		 411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  38.86 
 
 		 437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 		 440 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  37.11 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 		 440 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 		 440 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  35.7 
 
 		 442 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  38.32 
 
 		 437 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  38.32 
 
 		 437 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  38.32 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  37.23 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  36.68 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  37.01 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  38.57 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  36.52 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  36.76 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  36.76 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  36.52 
 
 		 423 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  36.52 
 
 		 423 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  37.1 
 
 		 417 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  36.52 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  38.29 
 
 		 434 aa  246  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.73 
 
 		 437 aa  246  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  36.27 
 
 		 423 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  36.27 
 
 		 423 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  35.75 
 
 		 436 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  34.89 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  36.56 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  39.34 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  33.91 
 
 		 443 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  36.32 
 
 		 426 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  36.48 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  34.95 
 
 		 449 aa  236  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  39.45 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  39.45 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  39.45 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  39.45 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  32.85 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  32.85 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  32.85 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  32.85 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  32.85 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  33.5 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  38.21 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
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NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  34.91 
 
 		 437 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  38.58 
 
 		 419 aa  229  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  35.95 
 
 		 440 aa  229  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
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NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  33.01 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  34.22 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
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NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  38.27 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
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NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  38.78 
 
 		 416 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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