More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2027 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  100 
 
 		 596 aa  1237    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  45.15 
 
 		 601 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.33 
 
 		 607 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  39.97 
 
 		 605 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.78 
 
 		 624 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.66 
 
 		 626 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  39.27 
 
 		 598 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  35.32 
 
 		 595 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  35.32 
 
 		 595 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.85 
 
 		 610 aa  313  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.03 
 
 		 593 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.7 
 
 		 604 aa  270  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.94 
 
 		 590 aa  263  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.55 
 
 		 597 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.4 
 
 		 618 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  29.19 
 
 		 601 aa  261  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.8 
 
 		 615 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.17 
 
 		 610 aa  257  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  29.93 
 
 		 590 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.51 
 
 		 586 aa  250  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.66 
 
 		 594 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  32.19 
 
 		 597 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.46 
 
 		 597 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  37.86 
 
 		 243 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.03 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  33.95 
 
 		 521 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  33.58 
 
 		 521 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  56.25 
 
 		 112 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.76 
 
 		 438 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.14 
 
 		 555 aa  135  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.22 
 
 		 558 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.15 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.15 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  31.56 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  31.54 
 
 		 538 aa  130  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.4 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  30.22 
 
 		 893 aa  112  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  34.78 
 
 		 1088 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  35.29 
 
 		 1085 aa  108  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  31.13 
 
 		 872 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  29.25 
 
 		 846 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  29.57 
 
 		 956 aa  100  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  30.95 
 
 		 897 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  33.82 
 
 		 968 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  26.23 
 
 		 793 aa  98.2  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  32.68 
 
 		 864 aa  98.2  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  35.65 
 
 		 883 aa  98.2  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  29.67 
 
 		 917 aa  97.8  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  32.43 
 
 		 872 aa  97.8  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.47 
 
 		 442 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  35.5 
 
 		 793 aa  97.4  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  28.41 
 
 		 846 aa  97.1  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  32.86 
 
 		 903 aa  97.1  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  33.04 
 
 		 896 aa  97.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  27.99 
 
 		 858 aa  97.1  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  30.04 
 
 		 881 aa  97.1  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.09 
 
 		 443 aa  97.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  30.63 
 
 		 880 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  30.8 
 
 		 918 aa  94.7  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  30.95 
 
 		 932 aa  95.1  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.82 
 
 		 450 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  32.86 
 
 		 863 aa  94.4  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  30.14 
 
 		 870 aa  94  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  30.14 
 
 		 870 aa  94  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 858 aa  93.6  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  35 
 
 		 897 aa  93.6  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  28.24 
 
 		 857 aa  93.6  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  31.06 
 
 		 880 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  28.69 
 
 		 840 aa  93.2  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  33 
 
 		 865 aa  93.2  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2017  DNA mismatch repair protein MutS  31.84 
 
 		 1014 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  29.31 
 
 		 868 aa  92.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  33.19 
 
 		 904 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  32.23 
 
 		 855 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  30.95 
 
 		 853 aa  92  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0273  DNA mismatch repair protein MutS  31.87 
 
 		 1040 aa  92  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  32.23 
 
 		 855 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  29.37 
 
 		 896 aa  91.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.96 
 
 		 423 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  31.58 
 
 		 873 aa  91.3  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  30.04 
 
 		 870 aa  91.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  29.96 
 
 		 860 aa  91.3  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  29.27 
 
 		 819 aa  91.3  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 		 898 aa  90.9  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  29.37 
 
 		 863 aa  91.3  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  34.29 
 
 		 817 aa  90.9  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  32.89 
 
 		 893 aa  90.5  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0247  DNA mismatch repair protein MutS  32.78 
 
 		 1058 aa  90.5  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  30.68 
 
 		 881 aa  90.1  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  31.54 
 
 		 882 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  32.44 
 
 		 891 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  33.03 
 
 		 868 aa  89.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  29.55 
 
 		 887 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  29.32 
 
 		 867 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  32.44 
 
 		 891 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40782  predicted protein  33.7 
 
 		 1113 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119207  normal  0.227387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  30.86 
 
 		 881 aa  89  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  33.18 
 
 		 851 aa  88.6  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  32.44 
 
 		 939 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  32.44 
 
 		 939 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>