More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3367 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3367  cytochrome P450-like protein  100 
 
 		 392 aa  776    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4349  putative cytochrome P450  51.59 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0143  cytochrome P450  48.55 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3655  putative cytochrome P450  41.96 
 
 		 416 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1965  cytochrome P450  43.73 
 
 		 400 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  27.41 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  30.19 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  29.5 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  30.36 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0359  cytochrome P450  31.25 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  29.64 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  30.96 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  29.34 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  28.57 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  29.9 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  28.95 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  26.65 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  26.37 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  28.8 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  27.35 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  28.48 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  26.45 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  25.24 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  28.9 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  28.57 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  28.9 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  28.57 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  29.73 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  28.02 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  28.57 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  25.88 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  27.33 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  28.9 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  26.56 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  28.25 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  30.13 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  27.12 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  29.27 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  26.96 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  29.15 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  27.3 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  25.7 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  27.99 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  26.46 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  27.99 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  27.99 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  27.24 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  26.82 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  26.04 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  26.82 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  28.57 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  26.79 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  26.7 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  28.49 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  25.53 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  33.82 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  26.42 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  25.24 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  26.28 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  26.95 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  29.09 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  30.03 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  32.34 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  27.42 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  28.77 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  29.68 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  28.81 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  28.3 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  27.67 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  27.61 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1735  cytochrome P450  29.45 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  28.43 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  26.33 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1012  cytochrome P450  21.93 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  28.04 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  27.03 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  27.27 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  27.45 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  26.33 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  27.04 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  29.91 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  26.33 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  27.04 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  26.7 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  29.28 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0512  cytochrome P450  26.04 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  30.27 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  24.04 
 
 		 420 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  27.09 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  32.14 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1485  cytochrome P450  27.9 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1507  cytochrome P450  27.9 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  25.32 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  29.31 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  27.18 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  29.31 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  29.07 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  27.69 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1912  cytochrome P450  27.48 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.997168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0929  cytochrome P450  38.61 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>